Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZP7

LIN54, Protein lin-54 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN54Q6MZP7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN54Q6MZP7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN54Q6MZP7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN54Q6MZP7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN54Q6MZP7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN54Q6MZP7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN54Q6MZP7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIN54Q6MZP7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN54Q6MZP7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN54Q6MZP7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN54Q6MZP7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN54Q6MZP7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN54Q6MZP7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN54Q6MZP7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIN54Q6MZP7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LIN54Q6MZP7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIN54Q6MZP7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIN54Q6MZP7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN54Q6MZP7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIN54Q6MZP7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIN54Q6MZP7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIN54Q6MZP7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIN54Q6MZP7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIN54Q6MZP7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN54Q6MZP7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN54Q6MZP7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN54Q6MZP7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN54Q6MZP7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN54Q6MZP7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN54Q6MZP7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN54Q6MZP7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN54Q6MZP7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN54Q6MZP7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN54Q6MZP7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN54Q6MZP7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN54Q6MZP7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN54Q6MZP7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN54Q6MZP7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN54Q6MZP7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN54Q6MZP7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN54Q6MZP7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN54Q6MZP7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN54Q6MZP7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN54Q6MZP7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN54Q6MZP7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN54Q6MZP7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN54Q6MZP7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN54Q6MZP7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN54Q6MZP7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN54Q6MZP7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN54Q6MZP7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIN54Q6MZP7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIN54Q6MZP7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN54Q6MZP7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN54Q6MZP7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN54Q6MZP7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN54Q6MZP7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN54Q6MZP7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN54Q6MZP7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LIN54Q6MZP7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN54Q6MZP7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN54Q6MZP7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN54Q6MZP7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN54Q6MZP7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN54Q6MZP7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIN54Q6MZP7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIN54Q6MZP7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN54Q6MZP7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN54Q6MZP7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN54Q6MZP7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LIN54Q6MZP7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIN54Q6MZP7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN54Q6MZP7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIN54Q6MZP7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIN54Q6MZP7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIN54Q6MZP7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIN54Q6MZP7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN54Q6MZP7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIN54Q6MZP7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIN54Q6MZP7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN54Q6MZP7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN54Q6MZP7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN54Q6MZP7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN54Q6MZP7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN54Q6MZP7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN54Q6MZP7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN54Q6MZP7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN54Q6MZP7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN54Q6MZP7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN54Q6MZP7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN54Q6MZP7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN54Q6MZP7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN54Q6MZP7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN54Q6MZP7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN54Q6MZP7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN54Q6MZP7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIN54Q6MZP7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN54Q6MZP7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN54Q6MZP7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN54Q6MZP7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms