Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZM9

PRR27, Proline-rich protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR27Q6MZM9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR27Q6MZM9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR27Q6MZM9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR27Q6MZM9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR27Q6MZM9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR27Q6MZM9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR27Q6MZM9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR27Q6MZM9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRR27Q6MZM9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR27Q6MZM9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR27Q6MZM9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR27Q6MZM9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR27Q6MZM9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR27Q6MZM9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR27Q6MZM9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRR27Q6MZM9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRR27Q6MZM9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRR27Q6MZM9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRR27Q6MZM9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRR27Q6MZM9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRR27Q6MZM9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRR27Q6MZM9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRR27Q6MZM9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRR27Q6MZM9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRR27Q6MZM9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRR27Q6MZM9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRR27Q6MZM9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRR27Q6MZM9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRR27Q6MZM9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRR27Q6MZM9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRR27Q6MZM9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRR27Q6MZM9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRR27Q6MZM9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRR27Q6MZM9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRR27Q6MZM9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRR27Q6MZM9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRR27Q6MZM9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRR27Q6MZM9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRR27Q6MZM9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRR27Q6MZM9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRR27Q6MZM9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRR27Q6MZM9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRR27Q6MZM9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRR27Q6MZM9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRR27Q6MZM9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRR27Q6MZM9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRR27Q6MZM9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRR27Q6MZM9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRR27Q6MZM9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRR27Q6MZM9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRR27Q6MZM9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRR27Q6MZM9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRR27Q6MZM9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRR27Q6MZM9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRR27Q6MZM9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRR27Q6MZM9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRR27Q6MZM9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR27Q6MZM9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRR27Q6MZM9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRR27Q6MZM9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRR27Q6MZM9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRR27Q6MZM9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRR27Q6MZM9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRR27Q6MZM9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRR27Q6MZM9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRR27Q6MZM9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRR27Q6MZM9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRR27Q6MZM9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRR27Q6MZM9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRR27Q6MZM9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRR27Q6MZM9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRR27Q6MZM9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRR27Q6MZM9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRR27Q6MZM9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRR27Q6MZM9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRR27Q6MZM9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRR27Q6MZM9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR27Q6MZM9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRR27Q6MZM9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRR27Q6MZM9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRR27Q6MZM9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRR27Q6MZM9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRR27Q6MZM9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRR27Q6MZM9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRR27Q6MZM9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR27Q6MZM9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR27Q6MZM9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRR27Q6MZM9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRR27Q6MZM9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRR27Q6MZM9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRR27Q6MZM9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRR27Q6MZM9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRR27Q6MZM9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRR27Q6MZM9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRR27Q6MZM9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRR27Q6MZM9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRR27Q6MZM9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRR27Q6MZM9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRR27Q6MZM9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRR27Q6MZM9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms