Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIE3

VWA5B1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B1Q5TIE3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VWA5B1Q5TIE3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
VWA5B1Q5TIE3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VWA5B1Q5TIE3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VWA5B1Q5TIE3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VWA5B1Q5TIE3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VWA5B1Q5TIE3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VWA5B1Q5TIE3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VWA5B1Q5TIE3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VWA5B1Q5TIE3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWA5B1Q5TIE3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWA5B1Q5TIE3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWA5B1Q5TIE3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWA5B1Q5TIE3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWA5B1Q5TIE3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWA5B1Q5TIE3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWA5B1Q5TIE3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWA5B1Q5TIE3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
VWA5B1Q5TIE3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWA5B1Q5TIE3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWA5B1Q5TIE3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VWA5B1Q5TIE3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VWA5B1Q5TIE3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VWA5B1Q5TIE3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VWA5B1Q5TIE3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VWA5B1Q5TIE3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VWA5B1Q5TIE3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VWA5B1Q5TIE3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VWA5B1Q5TIE3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VWA5B1Q5TIE3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VWA5B1Q5TIE3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWA5B1Q5TIE3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VWA5B1Q5TIE3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWA5B1Q5TIE3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWA5B1Q5TIE3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWA5B1Q5TIE3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWA5B1Q5TIE3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWA5B1Q5TIE3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
VWA5B1Q5TIE3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWA5B1Q5TIE3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWA5B1Q5TIE3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VWA5B1Q5TIE3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VWA5B1Q5TIE3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWA5B1Q5TIE3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWA5B1Q5TIE3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWA5B1Q5TIE3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWA5B1Q5TIE3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWA5B1Q5TIE3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWA5B1Q5TIE3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWA5B1Q5TIE3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWA5B1Q5TIE3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA5B1Q5TIE3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWA5B1Q5TIE3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWA5B1Q5TIE3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWA5B1Q5TIE3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWA5B1Q5TIE3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA5B1Q5TIE3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VWA5B1Q5TIE3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VWA5B1Q5TIE3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VWA5B1Q5TIE3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VWA5B1Q5TIE3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
VWA5B1Q5TIE3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA5B1Q5TIE3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA5B1Q5TIE3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VWA5B1Q5TIE3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VWA5B1Q5TIE3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VWA5B1Q5TIE3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VWA5B1Q5TIE3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VWA5B1Q5TIE3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VWA5B1Q5TIE3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA5B1Q5TIE3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWA5B1Q5TIE3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWA5B1Q5TIE3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWA5B1Q5TIE3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VWA5B1Q5TIE3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VWA5B1Q5TIE3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VWA5B1Q5TIE3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VWA5B1Q5TIE3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWA5B1Q5TIE3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VWA5B1Q5TIE3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWA5B1Q5TIE3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VWA5B1Q5TIE3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VWA5B1Q5TIE3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWA5B1Q5TIE3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWA5B1Q5TIE3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VWA5B1Q5TIE3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWA5B1Q5TIE3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VWA5B1Q5TIE3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VWA5B1Q5TIE3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VWA5B1Q5TIE3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VWA5B1Q5TIE3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VWA5B1Q5TIE3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWA5B1Q5TIE3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VWA5B1Q5TIE3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VWA5B1Q5TIE3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VWA5B1Q5TIE3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
VWA5B1Q5TIE3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VWA5B1Q5TIE3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWA5B1Q5TIE3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VWA5B1Q5TIE3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms