Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC12

ATPAF1, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPAF1Q5TC12 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATPAF1Q5TC12 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATPAF1Q5TC12 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATPAF1Q5TC12 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATPAF1Q5TC12 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATPAF1Q5TC12 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATPAF1Q5TC12 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATPAF1Q5TC12 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATPAF1Q5TC12 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATPAF1Q5TC12 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATPAF1Q5TC12 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATPAF1Q5TC12 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATPAF1Q5TC12 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATPAF1Q5TC12 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATPAF1Q5TC12 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATPAF1Q5TC12 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATPAF1Q5TC12 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATPAF1Q5TC12 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATPAF1Q5TC12 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATPAF1Q5TC12 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATPAF1Q5TC12 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATPAF1Q5TC12 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATPAF1Q5TC12 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATPAF1Q5TC12 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATPAF1Q5TC12 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATPAF1Q5TC12 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATPAF1Q5TC12 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATPAF1Q5TC12 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATPAF1Q5TC12 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATPAF1Q5TC12 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATPAF1Q5TC12 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATPAF1Q5TC12 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATPAF1Q5TC12 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATPAF1Q5TC12 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATPAF1Q5TC12 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATPAF1Q5TC12 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATPAF1Q5TC12 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATPAF1Q5TC12 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATPAF1Q5TC12 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATPAF1Q5TC12 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATPAF1Q5TC12 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATPAF1Q5TC12 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATPAF1Q5TC12 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATPAF1Q5TC12 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATPAF1Q5TC12 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATPAF1Q5TC12 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATPAF1Q5TC12 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATPAF1Q5TC12 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATPAF1Q5TC12 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATPAF1Q5TC12 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATPAF1Q5TC12 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATPAF1Q5TC12 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATPAF1Q5TC12 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATPAF1Q5TC12 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATPAF1Q5TC12 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATPAF1Q5TC12 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATPAF1Q5TC12 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATPAF1Q5TC12 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATPAF1Q5TC12 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATPAF1Q5TC12 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPAF1Q5TC12 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPAF1Q5TC12 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATPAF1Q5TC12 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATPAF1Q5TC12 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATPAF1Q5TC12 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATPAF1Q5TC12 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATPAF1Q5TC12 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATPAF1Q5TC12 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATPAF1Q5TC12 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATPAF1Q5TC12 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATPAF1Q5TC12 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATPAF1Q5TC12 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATPAF1Q5TC12 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATPAF1Q5TC12 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATPAF1Q5TC12 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATPAF1Q5TC12 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATPAF1Q5TC12 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATPAF1Q5TC12 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATPAF1Q5TC12 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATPAF1Q5TC12 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATPAF1Q5TC12 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATPAF1Q5TC12 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATPAF1Q5TC12 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATPAF1Q5TC12 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATPAF1Q5TC12 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATPAF1Q5TC12 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATPAF1Q5TC12 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATPAF1Q5TC12 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATPAF1Q5TC12 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATPAF1Q5TC12 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATPAF1Q5TC12 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATPAF1Q5TC12 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATPAF1Q5TC12 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATPAF1Q5TC12 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATPAF1Q5TC12 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATPAF1Q5TC12 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATPAF1Q5TC12 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATPAF1Q5TC12 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATPAF1Q5TC12 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATPAF1Q5TC12 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms