Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM201Q5SNT2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM201Q5SNT2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM201Q5SNT2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM201Q5SNT2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM201Q5SNT2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM201Q5SNT2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM201Q5SNT2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM201Q5SNT2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM201Q5SNT2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM201Q5SNT2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM201Q5SNT2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM201Q5SNT2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM201Q5SNT2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM201Q5SNT2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM201Q5SNT2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM201Q5SNT2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM201Q5SNT2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM201Q5SNT2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM201Q5SNT2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM201Q5SNT2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM201Q5SNT2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM201Q5SNT2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM201Q5SNT2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM201Q5SNT2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM201Q5SNT2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM201Q5SNT2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM201Q5SNT2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM201Q5SNT2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM201Q5SNT2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM201Q5SNT2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM201Q5SNT2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM201Q5SNT2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM201Q5SNT2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM201Q5SNT2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM201Q5SNT2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMEM201Q5SNT2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM201Q5SNT2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM201Q5SNT2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM201Q5SNT2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM201Q5SNT2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM201Q5SNT2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM201Q5SNT2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM201Q5SNT2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM201Q5SNT2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM201Q5SNT2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM201Q5SNT2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM201Q5SNT2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM201Q5SNT2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM201Q5SNT2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM201Q5SNT2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM201Q5SNT2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM201Q5SNT2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM201Q5SNT2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM201Q5SNT2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM201Q5SNT2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM201Q5SNT2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM201Q5SNT2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM201Q5SNT2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM201Q5SNT2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM201Q5SNT2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM201Q5SNT2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM201Q5SNT2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM201Q5SNT2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM201Q5SNT2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM201Q5SNT2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM201Q5SNT2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM201Q5SNT2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM201Q5SNT2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM201Q5SNT2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM201Q5SNT2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM201Q5SNT2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM201Q5SNT2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM201Q5SNT2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM201Q5SNT2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM201Q5SNT2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM201Q5SNT2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM201Q5SNT2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM201Q5SNT2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM201Q5SNT2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM201Q5SNT2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM201Q5SNT2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM201Q5SNT2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM201Q5SNT2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM201Q5SNT2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM201Q5SNT2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM201Q5SNT2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM201Q5SNT2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM201Q5SNT2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM201Q5SNT2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM201Q5SNT2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM201Q5SNT2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM201Q5SNT2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM201Q5SNT2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM201Q5SNT2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM201Q5SNT2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM201Q5SNT2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM201Q5SNT2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM201Q5SNT2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM201Q5SNT2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms