Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXF1

FAM74A3, Putative protein FAM74A3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A3Q4VXF1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM74A3Q4VXF1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM74A3Q4VXF1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM74A3Q4VXF1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM74A3Q4VXF1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM74A3Q4VXF1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM74A3Q4VXF1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM74A3Q4VXF1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM74A3Q4VXF1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM74A3Q4VXF1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM74A3Q4VXF1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM74A3Q4VXF1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM74A3Q4VXF1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM74A3Q4VXF1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM74A3Q4VXF1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM74A3Q4VXF1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM74A3Q4VXF1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM74A3Q4VXF1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM74A3Q4VXF1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM74A3Q4VXF1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM74A3Q4VXF1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM74A3Q4VXF1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM74A3Q4VXF1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM74A3Q4VXF1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM74A3Q4VXF1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM74A3Q4VXF1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM74A3Q4VXF1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM74A3Q4VXF1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM74A3Q4VXF1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM74A3Q4VXF1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM74A3Q4VXF1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM74A3Q4VXF1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM74A3Q4VXF1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM74A3Q4VXF1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM74A3Q4VXF1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM74A3Q4VXF1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM74A3Q4VXF1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM74A3Q4VXF1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM74A3Q4VXF1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM74A3Q4VXF1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM74A3Q4VXF1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM74A3Q4VXF1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM74A3Q4VXF1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM74A3Q4VXF1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM74A3Q4VXF1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM74A3Q4VXF1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM74A3Q4VXF1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM74A3Q4VXF1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM74A3Q4VXF1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM74A3Q4VXF1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM74A3Q4VXF1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM74A3Q4VXF1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM74A3Q4VXF1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM74A3Q4VXF1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM74A3Q4VXF1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM74A3Q4VXF1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM74A3Q4VXF1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM74A3Q4VXF1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM74A3Q4VXF1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM74A3Q4VXF1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM74A3Q4VXF1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM74A3Q4VXF1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM74A3Q4VXF1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM74A3Q4VXF1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM74A3Q4VXF1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM74A3Q4VXF1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM74A3Q4VXF1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM74A3Q4VXF1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM74A3Q4VXF1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM74A3Q4VXF1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM74A3Q4VXF1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM74A3Q4VXF1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM74A3Q4VXF1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM74A3Q4VXF1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM74A3Q4VXF1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM74A3Q4VXF1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM74A3Q4VXF1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM74A3Q4VXF1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM74A3Q4VXF1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM74A3Q4VXF1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM74A3Q4VXF1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM74A3Q4VXF1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM74A3Q4VXF1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM74A3Q4VXF1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM74A3Q4VXF1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM74A3Q4VXF1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM74A3Q4VXF1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM74A3Q4VXF1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM74A3Q4VXF1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM74A3Q4VXF1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM74A3Q4VXF1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM74A3Q4VXF1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM74A3Q4VXF1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM74A3Q4VXF1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM74A3Q4VXF1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM74A3Q4VXF1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM74A3Q4VXF1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM74A3Q4VXF1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM74A3Q4VXF1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM74A3Q4VXF1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms