Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM30BQ3MIR4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM30BQ3MIR4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM30BQ3MIR4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM30BQ3MIR4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM30BQ3MIR4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM30BQ3MIR4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM30BQ3MIR4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM30BQ3MIR4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM30BQ3MIR4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM30BQ3MIR4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM30BQ3MIR4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30BQ3MIR4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM30BQ3MIR4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM30BQ3MIR4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM30BQ3MIR4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM30BQ3MIR4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM30BQ3MIR4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM30BQ3MIR4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM30BQ3MIR4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM30BQ3MIR4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM30BQ3MIR4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM30BQ3MIR4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM30BQ3MIR4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM30BQ3MIR4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM30BQ3MIR4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM30BQ3MIR4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM30BQ3MIR4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM30BQ3MIR4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM30BQ3MIR4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM30BQ3MIR4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM30BQ3MIR4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM30BQ3MIR4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM30BQ3MIR4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM30BQ3MIR4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM30BQ3MIR4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM30BQ3MIR4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM30BQ3MIR4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM30BQ3MIR4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM30BQ3MIR4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM30BQ3MIR4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM30BQ3MIR4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30BQ3MIR4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30BQ3MIR4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM30BQ3MIR4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM30BQ3MIR4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM30BQ3MIR4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM30BQ3MIR4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM30BQ3MIR4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM30BQ3MIR4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM30BQ3MIR4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM30BQ3MIR4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM30BQ3MIR4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM30BQ3MIR4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM30BQ3MIR4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30BQ3MIR4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM30BQ3MIR4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM30BQ3MIR4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM30BQ3MIR4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM30BQ3MIR4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM30BQ3MIR4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM30BQ3MIR4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM30BQ3MIR4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM30BQ3MIR4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM30BQ3MIR4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM30BQ3MIR4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM30BQ3MIR4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM30BQ3MIR4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM30BQ3MIR4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM30BQ3MIR4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM30BQ3MIR4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM30BQ3MIR4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30BQ3MIR4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM30BQ3MIR4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM30BQ3MIR4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM30BQ3MIR4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM30BQ3MIR4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM30BQ3MIR4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM30BQ3MIR4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM30BQ3MIR4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM30BQ3MIR4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM30BQ3MIR4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM30BQ3MIR4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM30BQ3MIR4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM30BQ3MIR4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM30BQ3MIR4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM30BQ3MIR4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM30BQ3MIR4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM30BQ3MIR4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM30BQ3MIR4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM30BQ3MIR4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM30BQ3MIR4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM30BQ3MIR4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM30BQ3MIR4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM30BQ3MIR4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM30BQ3MIR4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM30BQ3MIR4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM30BQ3MIR4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM30BQ3MIR4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM30BQ3MIR4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms