Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BRD3Q15059 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRD3Q15059 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRD3Q15059 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRD3Q15059 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BRD3Q15059 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BRD3Q15059 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
BRD3Q15059 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRD3Q15059 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BRD3Q15059 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
BRD3Q15059 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BRD3Q15059 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BRD3Q15059 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
BRD3Q15059 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BRD3Q15059 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BRD3Q15059 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BRD3Q15059 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BRD3Q15059 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BRD3Q15059 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRD3Q15059 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BRD3Q15059 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BRD3Q15059 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRD3Q15059 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
BRD3Q15059 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRD3Q15059 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
BRD3Q15059 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
BRD3Q15059 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BRD3Q15059 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BRD3Q15059 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BRD3Q15059 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BRD3Q15059 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BRD3Q15059 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BRD3Q15059 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BRD3Q15059 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BRD3Q15059 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRD3Q15059 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BRD3Q15059 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
BRD3Q15059 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BRD3Q15059 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRD3Q15059 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRD3Q15059 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRD3Q15059 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
BRD3Q15059 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BRD3Q15059 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BRD3Q15059 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BRD3Q15059 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BRD3Q15059 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BRD3Q15059 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BRD3Q15059 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BRD3Q15059 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BRD3Q15059 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BRD3Q15059 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRD3Q15059 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRD3Q15059 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD3Q15059 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD3Q15059 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRD3Q15059 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRD3Q15059 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRD3Q15059 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRD3Q15059 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRD3Q15059 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRD3Q15059 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRD3Q15059 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRD3Q15059 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRD3Q15059 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRD3Q15059 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRD3Q15059 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRD3Q15059 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRD3Q15059 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
BRD3Q15059 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
BRD3Q15059 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRD3Q15059 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRD3Q15059 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRD3Q15059 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRD3Q15059 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRD3Q15059 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BRD3Q15059 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRD3Q15059 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRD3Q15059 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRD3Q15059 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRD3Q15059 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRD3Q15059 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRD3Q15059 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRD3Q15059 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRD3Q15059 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRD3Q15059 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRD3Q15059 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRD3Q15059 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRD3Q15059 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRD3Q15059 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRD3Q15059 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRD3Q15059 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRD3Q15059 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRD3Q15059 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRD3Q15059 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRD3Q15059 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRD3Q15059 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRD3Q15059 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRD3Q15059 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
BRD3Q15059 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
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