Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CDR2Q01850 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDR2Q01850 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDR2Q01850 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDR2Q01850 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDR2Q01850 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDR2Q01850 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CDR2Q01850 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDR2Q01850 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDR2Q01850 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDR2Q01850 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDR2Q01850 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDR2Q01850 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDR2Q01850 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDR2Q01850 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDR2Q01850 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDR2Q01850 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDR2Q01850 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDR2Q01850 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDR2Q01850 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CDR2Q01850 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDR2Q01850 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDR2Q01850 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDR2Q01850 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CDR2Q01850 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDR2Q01850 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CDR2Q01850 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CDR2Q01850 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDR2Q01850 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDR2Q01850 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDR2Q01850 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDR2Q01850 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDR2Q01850 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDR2Q01850 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDR2Q01850 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CDR2Q01850 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDR2Q01850 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDR2Q01850 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDR2Q01850 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CDR2Q01850 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDR2Q01850 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDR2Q01850 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDR2Q01850 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDR2Q01850 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDR2Q01850 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDR2Q01850 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDR2Q01850 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDR2Q01850 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDR2Q01850 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDR2Q01850 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDR2Q01850 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDR2Q01850 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDR2Q01850 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDR2Q01850 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDR2Q01850 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDR2Q01850 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDR2Q01850 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDR2Q01850 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDR2Q01850 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDR2Q01850 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDR2Q01850 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDR2Q01850 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CDR2Q01850 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDR2Q01850 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDR2Q01850 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDR2Q01850 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDR2Q01850 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDR2Q01850 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDR2Q01850 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDR2Q01850 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDR2Q01850 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDR2Q01850 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDR2Q01850 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDR2Q01850 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDR2Q01850 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CDR2Q01850 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDR2Q01850 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDR2Q01850 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDR2Q01850 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDR2Q01850 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CDR2Q01850 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDR2Q01850 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDR2Q01850 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDR2Q01850 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDR2Q01850 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDR2Q01850 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDR2Q01850 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDR2Q01850 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDR2Q01850 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDR2Q01850 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDR2Q01850 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDR2Q01850 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDR2Q01850 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDR2Q01850 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDR2Q01850 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDR2Q01850 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDR2Q01850 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDR2Q01850 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDR2Q01850 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDR2Q01850 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms