Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYBPC1Q00872 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYBPC1Q00872 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYBPC1Q00872 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYBPC1Q00872 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYBPC1Q00872 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYBPC1Q00872 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYBPC1Q00872 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYBPC1Q00872 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYBPC1Q00872 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYBPC1Q00872 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYBPC1Q00872 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYBPC1Q00872 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYBPC1Q00872 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYBPC1Q00872 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYBPC1Q00872 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYBPC1Q00872 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYBPC1Q00872 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYBPC1Q00872 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYBPC1Q00872 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYBPC1Q00872 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYBPC1Q00872 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYBPC1Q00872 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MYBPC1Q00872 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYBPC1Q00872 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYBPC1Q00872 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYBPC1Q00872 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYBPC1Q00872 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYBPC1Q00872 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYBPC1Q00872 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYBPC1Q00872 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYBPC1Q00872 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYBPC1Q00872 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYBPC1Q00872 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYBPC1Q00872 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYBPC1Q00872 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYBPC1Q00872 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYBPC1Q00872 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYBPC1Q00872 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYBPC1Q00872 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYBPC1Q00872 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYBPC1Q00872 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYBPC1Q00872 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYBPC1Q00872 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYBPC1Q00872 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYBPC1Q00872 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYBPC1Q00872 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYBPC1Q00872 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYBPC1Q00872 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYBPC1Q00872 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYBPC1Q00872 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYBPC1Q00872 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYBPC1Q00872 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYBPC1Q00872 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYBPC1Q00872 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYBPC1Q00872 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYBPC1Q00872 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYBPC1Q00872 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYBPC1Q00872 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYBPC1Q00872 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYBPC1Q00872 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYBPC1Q00872 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYBPC1Q00872 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYBPC1Q00872 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYBPC1Q00872 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYBPC1Q00872 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYBPC1Q00872 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYBPC1Q00872 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYBPC1Q00872 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYBPC1Q00872 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYBPC1Q00872 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYBPC1Q00872 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYBPC1Q00872 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYBPC1Q00872 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MYBPC1Q00872 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYBPC1Q00872 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYBPC1Q00872 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYBPC1Q00872 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MYBPC1Q00872 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYBPC1Q00872 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYBPC1Q00872 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYBPC1Q00872 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYBPC1Q00872 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MYBPC1Q00872 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYBPC1Q00872 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYBPC1Q00872 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYBPC1Q00872 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYBPC1Q00872 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYBPC1Q00872 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYBPC1Q00872 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYBPC1Q00872 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYBPC1Q00872 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYBPC1Q00872 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYBPC1Q00872 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYBPC1Q00872 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYBPC1Q00872 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MYBPC1Q00872 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYBPC1Q00872 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MYBPC1Q00872 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYBPC1Q00872 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.7 ms