Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.73
MYBPC1Q00872 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYBPC1Q00872 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MYBPC1Q00872 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
MYBPC1Q00872 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
MYBPC1Q00872 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MYBPC1Q00872 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MYBPC1Q00872 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MYBPC1Q00872 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYBPC1Q00872 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYBPC1Q00872 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MYBPC1Q00872 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYBPC1Q00872 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MYBPC1Q00872 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MYBPC1Q00872 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MYBPC1Q00872 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
MYBPC1Q00872 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MYBPC1Q00872 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYBPC1Q00872 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYBPC1Q00872 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYBPC1Q00872 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYBPC1Q00872 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYBPC1Q00872 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MYBPC1Q00872 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYBPC1Q00872 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYBPC1Q00872 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MYBPC1Q00872 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYBPC1Q00872 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYBPC1Q00872 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYBPC1Q00872 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYBPC1Q00872 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYBPC1Q00872 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYBPC1Q00872 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYBPC1Q00872 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYBPC1Q00872 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYBPC1Q00872 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYBPC1Q00872 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYBPC1Q00872 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYBPC1Q00872 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYBPC1Q00872 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYBPC1Q00872 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYBPC1Q00872 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MYBPC1Q00872 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYBPC1Q00872 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYBPC1Q00872 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYBPC1Q00872 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYBPC1Q00872 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYBPC1Q00872 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYBPC1Q00872 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYBPC1Q00872 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYBPC1Q00872 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYBPC1Q00872 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYBPC1Q00872 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYBPC1Q00872 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYBPC1Q00872 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYBPC1Q00872 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYBPC1Q00872 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYBPC1Q00872 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYBPC1Q00872 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYBPC1Q00872 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYBPC1Q00872 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MYBPC1Q00872 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MYBPC1Q00872 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYBPC1Q00872 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYBPC1Q00872 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYBPC1Q00872 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYBPC1Q00872 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYBPC1Q00872 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYBPC1Q00872 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYBPC1Q00872 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYBPC1Q00872 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYBPC1Q00872 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MYBPC1Q00872 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYBPC1Q00872 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYBPC1Q00872 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYBPC1Q00872 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYBPC1Q00872 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MYBPC1Q00872 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MYBPC1Q00872 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYBPC1Q00872 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MYBPC1Q00872 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYBPC1Q00872 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYBPC1Q00872 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYBPC1Q00872 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYBPC1Q00872 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYBPC1Q00872 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYBPC1Q00872 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYBPC1Q00872 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYBPC1Q00872 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYBPC1Q00872 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYBPC1Q00872 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYBPC1Q00872 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYBPC1Q00872 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYBPC1Q00872 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYBPC1Q00872 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYBPC1Q00872 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYBPC1Q00872 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYBPC1Q00872 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYBPC1Q00872 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYBPC1Q00872 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms