Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VBP1P61758 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VBP1P61758 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VBP1P61758 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VBP1P61758 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VBP1P61758 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VBP1P61758 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VBP1P61758 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VBP1P61758 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VBP1P61758 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VBP1P61758 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VBP1P61758 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VBP1P61758 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VBP1P61758 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VBP1P61758 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VBP1P61758 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VBP1P61758 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VBP1P61758 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VBP1P61758 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VBP1P61758 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VBP1P61758 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VBP1P61758 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VBP1P61758 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VBP1P61758 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VBP1P61758 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VBP1P61758 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VBP1P61758 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VBP1P61758 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VBP1P61758 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VBP1P61758 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VBP1P61758 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VBP1P61758 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VBP1P61758 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VBP1P61758 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VBP1P61758 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VBP1P61758 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VBP1P61758 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VBP1P61758 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VBP1P61758 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VBP1P61758 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VBP1P61758 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VBP1P61758 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VBP1P61758 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VBP1P61758 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VBP1P61758 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VBP1P61758 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VBP1P61758 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VBP1P61758 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VBP1P61758 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VBP1P61758 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VBP1P61758 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VBP1P61758 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VBP1P61758 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VBP1P61758 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VBP1P61758 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VBP1P61758 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VBP1P61758 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VBP1P61758 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VBP1P61758 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VBP1P61758 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VBP1P61758 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VBP1P61758 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VBP1P61758 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VBP1P61758 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VBP1P61758 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VBP1P61758 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VBP1P61758 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VBP1P61758 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VBP1P61758 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VBP1P61758 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VBP1P61758 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VBP1P61758 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VBP1P61758 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VBP1P61758 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VBP1P61758 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VBP1P61758 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VBP1P61758 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VBP1P61758 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VBP1P61758 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VBP1P61758 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VBP1P61758 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VBP1P61758 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VBP1P61758 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VBP1P61758 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VBP1P61758 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VBP1P61758 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VBP1P61758 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VBP1P61758 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VBP1P61758 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VBP1P61758 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VBP1P61758 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VBP1P61758 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VBP1P61758 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VBP1P61758 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VBP1P61758 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VBP1P61758 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VBP1P61758 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VBP1P61758 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VBP1P61758 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VBP1P61758 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms