Protein–RNA interactions for Protein: P55318

FOXA3, Hepatocyte nuclear factor 3-gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXA3P55318 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXA3P55318 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXA3P55318 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXA3P55318 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXA3P55318 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXA3P55318 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXA3P55318 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXA3P55318 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXA3P55318 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXA3P55318 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXA3P55318 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXA3P55318 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXA3P55318 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXA3P55318 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXA3P55318 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXA3P55318 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXA3P55318 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXA3P55318 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXA3P55318 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXA3P55318 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXA3P55318 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXA3P55318 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXA3P55318 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXA3P55318 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXA3P55318 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXA3P55318 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXA3P55318 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXA3P55318 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXA3P55318 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXA3P55318 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXA3P55318 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXA3P55318 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXA3P55318 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXA3P55318 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXA3P55318 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXA3P55318 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXA3P55318 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXA3P55318 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXA3P55318 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXA3P55318 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXA3P55318 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXA3P55318 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXA3P55318 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXA3P55318 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXA3P55318 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXA3P55318 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXA3P55318 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXA3P55318 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXA3P55318 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXA3P55318 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXA3P55318 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXA3P55318 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXA3P55318 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXA3P55318 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXA3P55318 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXA3P55318 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXA3P55318 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXA3P55318 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXA3P55318 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXA3P55318 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXA3P55318 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXA3P55318 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXA3P55318 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXA3P55318 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXA3P55318 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXA3P55318 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXA3P55318 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXA3P55318 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXA3P55318 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXA3P55318 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXA3P55318 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXA3P55318 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXA3P55318 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXA3P55318 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXA3P55318 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXA3P55318 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXA3P55318 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXA3P55318 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXA3P55318 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXA3P55318 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FOXA3P55318 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FOXA3P55318 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXA3P55318 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXA3P55318 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXA3P55318 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXA3P55318 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXA3P55318 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXA3P55318 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXA3P55318 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXA3P55318 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXA3P55318 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXA3P55318 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXA3P55318 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXA3P55318 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXA3P55318 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXA3P55318 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXA3P55318 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXA3P55318 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXA3P55318 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXA3P55318 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms