Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2D1P51668 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2D1P51668 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2D1P51668 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2D1P51668 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2D1P51668 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2D1P51668 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2D1P51668 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE2D1P51668 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2D1P51668 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2D1P51668 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2D1P51668 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2D1P51668 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2D1P51668 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2D1P51668 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2D1P51668 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2D1P51668 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE2D1P51668 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2D1P51668 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2D1P51668 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2D1P51668 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2D1P51668 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2D1P51668 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE2D1P51668 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2D1P51668 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE2D1P51668 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE2D1P51668 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE2D1P51668 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UBE2D1P51668 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UBE2D1P51668 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2D1P51668 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2D1P51668 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE2D1P51668 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE2D1P51668 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE2D1P51668 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE2D1P51668 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE2D1P51668 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE2D1P51668 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2D1P51668 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2D1P51668 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2D1P51668 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2D1P51668 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE2D1P51668 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE2D1P51668 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2D1P51668 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2D1P51668 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2D1P51668 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2D1P51668 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2D1P51668 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE2D1P51668 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
UBE2D1P51668 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2D1P51668 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE2D1P51668 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
UBE2D1P51668 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UBE2D1P51668 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UBE2D1P51668 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE2D1P51668 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE2D1P51668 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE2D1P51668 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2D1P51668 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2D1P51668 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE2D1P51668 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE2D1P51668 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE2D1P51668 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE2D1P51668 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE2D1P51668 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE2D1P51668 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE2D1P51668 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE2D1P51668 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE2D1P51668 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2D1P51668 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2D1P51668 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBE2D1P51668 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBE2D1P51668 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2D1P51668 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE2D1P51668 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE2D1P51668 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2D1P51668 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2D1P51668 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE2D1P51668 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBE2D1P51668 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE2D1P51668 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBE2D1P51668 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE2D1P51668 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE2D1P51668 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE2D1P51668 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UBE2D1P51668 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
UBE2D1P51668 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
UBE2D1P51668 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
UBE2D1P51668 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
UBE2D1P51668 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
UBE2D1P51668 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
UBE2D1P51668 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
UBE2D1P51668 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
UBE2D1P51668 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
UBE2D1P51668 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE2D1P51668 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE2D1P51668 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE2D1P51668 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2D1P51668 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms