Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX2-1P43699 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX2-1P43699 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX2-1P43699 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX2-1P43699 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX2-1P43699 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX2-1P43699 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX2-1P43699 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX2-1P43699 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX2-1P43699 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX2-1P43699 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-1P43699 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-1P43699 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-1P43699 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-1P43699 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-1P43699 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-1P43699 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-1P43699 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-1P43699 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-1P43699 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-1P43699 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NKX2-1P43699 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX2-1P43699 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX2-1P43699 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX2-1P43699 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX2-1P43699 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX2-1P43699 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX2-1P43699 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-1P43699 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX2-1P43699 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-1P43699 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-1P43699 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-1P43699 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-1P43699 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-1P43699 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-1P43699 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-1P43699 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX2-1P43699 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX2-1P43699 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-1P43699 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-1P43699 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-1P43699 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX2-1P43699 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX2-1P43699 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-1P43699 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-1P43699 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-1P43699 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-1P43699 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX2-1P43699 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX2-1P43699 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX2-1P43699 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKX2-1P43699 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX2-1P43699 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX2-1P43699 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX2-1P43699 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX2-1P43699 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX2-1P43699 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX2-1P43699 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX2-1P43699 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX2-1P43699 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-1P43699 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-1P43699 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-1P43699 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-1P43699 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-1P43699 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-1P43699 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-1P43699 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-1P43699 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-1P43699 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-1P43699 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-1P43699 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX2-1P43699 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX2-1P43699 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX2-1P43699 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX2-1P43699 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX2-1P43699 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX2-1P43699 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX2-1P43699 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX2-1P43699 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX2-1P43699 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX2-1P43699 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-1P43699 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-1P43699 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-1P43699 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-1P43699 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-1P43699 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX2-1P43699 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-1P43699 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX2-1P43699 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX2-1P43699 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKX2-1P43699 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX2-1P43699 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-1P43699 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-1P43699 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-1P43699 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-1P43699 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-1P43699 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-1P43699 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-1P43699 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-1P43699 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms