Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PBX1P40424 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PBX1P40424 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PBX1P40424 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PBX1P40424 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PBX1P40424 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PBX1P40424 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PBX1P40424 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PBX1P40424 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PBX1P40424 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PBX1P40424 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PBX1P40424 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
PBX1P40424 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PBX1P40424 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PBX1P40424 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PBX1P40424 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PBX1P40424 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PBX1P40424 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PBX1P40424 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PBX1P40424 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PBX1P40424 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PBX1P40424 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PBX1P40424 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PBX1P40424 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PBX1P40424 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PBX1P40424 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PBX1P40424 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PBX1P40424 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PBX1P40424 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PBX1P40424 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PBX1P40424 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PBX1P40424 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PBX1P40424 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PBX1P40424 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PBX1P40424 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PBX1P40424 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PBX1P40424 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PBX1P40424 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PBX1P40424 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PBX1P40424 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PBX1P40424 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PBX1P40424 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PBX1P40424 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PBX1P40424 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PBX1P40424 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PBX1P40424 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PBX1P40424 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PBX1P40424 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PBX1P40424 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PBX1P40424 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PBX1P40424 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PBX1P40424 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PBX1P40424 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PBX1P40424 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PBX1P40424 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PBX1P40424 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PBX1P40424 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PBX1P40424 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PBX1P40424 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PBX1P40424 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PBX1P40424 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PBX1P40424 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PBX1P40424 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PBX1P40424 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PBX1P40424 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PBX1P40424 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PBX1P40424 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PBX1P40424 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PBX1P40424 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PBX1P40424 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PBX1P40424 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PBX1P40424 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PBX1P40424 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PBX1P40424 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PBX1P40424 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PBX1P40424 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PBX1P40424 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PBX1P40424 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PBX1P40424 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PBX1P40424 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PBX1P40424 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PBX1P40424 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PBX1P40424 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PBX1P40424 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PBX1P40424 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PBX1P40424 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PBX1P40424 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PBX1P40424 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PBX1P40424 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PBX1P40424 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PBX1P40424 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PBX1P40424 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PBX1P40424 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PBX1P40424 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PBX1P40424 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PBX1P40424 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PBX1P40424 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PBX1P40424 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PBX1P40424 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PBX1P40424 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms