Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP1P23763 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP1P23763 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP1P23763 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VAMP1P23763 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VAMP1P23763 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP1P23763 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VAMP1P23763 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAMP1P23763 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP1P23763 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP1P23763 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP1P23763 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VAMP1P23763 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAMP1P23763 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAMP1P23763 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP1P23763 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP1P23763 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP1P23763 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP1P23763 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAMP1P23763 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VAMP1P23763 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAMP1P23763 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP1P23763 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP1P23763 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAMP1P23763 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP1P23763 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP1P23763 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP1P23763 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP1P23763 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP1P23763 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP1P23763 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP1P23763 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP1P23763 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP1P23763 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAMP1P23763 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAMP1P23763 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAMP1P23763 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAMP1P23763 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAMP1P23763 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP1P23763 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP1P23763 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP1P23763 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP1P23763 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP1P23763 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAMP1P23763 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VAMP1P23763 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAMP1P23763 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAMP1P23763 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAMP1P23763 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAMP1P23763 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAMP1P23763 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAMP1P23763 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAMP1P23763 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAMP1P23763 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAMP1P23763 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAMP1P23763 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAMP1P23763 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAMP1P23763 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAMP1P23763 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAMP1P23763 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAMP1P23763 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAMP1P23763 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP1P23763 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAMP1P23763 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAMP1P23763 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAMP1P23763 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAMP1P23763 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAMP1P23763 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAMP1P23763 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP1P23763 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAMP1P23763 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP1P23763 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP1P23763 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAMP1P23763 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAMP1P23763 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAMP1P23763 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP1P23763 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP1P23763 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAMP1P23763 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAMP1P23763 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAMP1P23763 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAMP1P23763 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VAMP1P23763 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAMP1P23763 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP1P23763 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAMP1P23763 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP1P23763 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP1P23763 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP1P23763 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP1P23763 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP1P23763 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP1P23763 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAMP1P23763 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAMP1P23763 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAMP1P23763 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAMP1P23763 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAMP1P23763 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAMP1P23763 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAMP1P23763 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAMP1P23763 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms