Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR4A1P22736 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR4A1P22736 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR4A1P22736 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR4A1P22736 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR4A1P22736 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR4A1P22736 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR4A1P22736 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR4A1P22736 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR4A1P22736 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR4A1P22736 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR4A1P22736 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR4A1P22736 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR4A1P22736 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR4A1P22736 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR4A1P22736 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR4A1P22736 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR4A1P22736 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR4A1P22736 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR4A1P22736 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR4A1P22736 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR4A1P22736 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR4A1P22736 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR4A1P22736 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR4A1P22736 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR4A1P22736 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR4A1P22736 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR4A1P22736 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR4A1P22736 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR4A1P22736 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR4A1P22736 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR4A1P22736 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NR4A1P22736 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR4A1P22736 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR4A1P22736 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR4A1P22736 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR4A1P22736 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR4A1P22736 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NR4A1P22736 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR4A1P22736 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR4A1P22736 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR4A1P22736 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR4A1P22736 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR4A1P22736 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR4A1P22736 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR4A1P22736 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NR4A1P22736 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR4A1P22736 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR4A1P22736 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR4A1P22736 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR4A1P22736 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR4A1P22736 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR4A1P22736 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR4A1P22736 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR4A1P22736 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR4A1P22736 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR4A1P22736 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR4A1P22736 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR4A1P22736 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR4A1P22736 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR4A1P22736 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR4A1P22736 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR4A1P22736 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR4A1P22736 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NR4A1P22736 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR4A1P22736 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR4A1P22736 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR4A1P22736 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR4A1P22736 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR4A1P22736 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR4A1P22736 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR4A1P22736 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR4A1P22736 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR4A1P22736 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR4A1P22736 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR4A1P22736 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NR4A1P22736 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR4A1P22736 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NR4A1P22736 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR4A1P22736 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR4A1P22736 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR4A1P22736 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR4A1P22736 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR4A1P22736 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR4A1P22736 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR4A1P22736 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR4A1P22736 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR4A1P22736 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR4A1P22736 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR4A1P22736 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR4A1P22736 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR4A1P22736 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR4A1P22736 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR4A1P22736 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR4A1P22736 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR4A1P22736 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR4A1P22736 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR4A1P22736 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR4A1P22736 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR4A1P22736 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1181.7 ms