Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB1P14653 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB1P14653 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXB1P14653 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB1P14653 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXB1P14653 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXB1P14653 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXB1P14653 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXB1P14653 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXB1P14653 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB1P14653 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB1P14653 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB1P14653 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB1P14653 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB1P14653 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB1P14653 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB1P14653 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB1P14653 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB1P14653 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB1P14653 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB1P14653 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB1P14653 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB1P14653 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB1P14653 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB1P14653 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB1P14653 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB1P14653 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB1P14653 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB1P14653 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB1P14653 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB1P14653 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXB1P14653 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB1P14653 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB1P14653 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB1P14653 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB1P14653 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB1P14653 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXB1P14653 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB1P14653 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB1P14653 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB1P14653 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB1P14653 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB1P14653 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB1P14653 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB1P14653 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB1P14653 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB1P14653 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB1P14653 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB1P14653 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXB1P14653 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXB1P14653 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXB1P14653 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXB1P14653 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXB1P14653 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB1P14653 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB1P14653 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB1P14653 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB1P14653 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB1P14653 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB1P14653 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB1P14653 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB1P14653 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB1P14653 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB1P14653 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB1P14653 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB1P14653 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB1P14653 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB1P14653 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB1P14653 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB1P14653 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB1P14653 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB1P14653 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB1P14653 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB1P14653 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB1P14653 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB1P14653 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB1P14653 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB1P14653 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB1P14653 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB1P14653 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB1P14653 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB1P14653 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB1P14653 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB1P14653 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB1P14653 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB1P14653 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB1P14653 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB1P14653 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB1P14653 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB1P14653 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB1P14653 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB1P14653 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB1P14653 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXB1P14653 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB1P14653 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB1P14653 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB1P14653 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB1P14653 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB1P14653 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB1P14653 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms