Protein–RNA interactions for Protein: P0C672

TSPAN19, Putative tetraspanin-19, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN19P0C672 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSPAN19P0C672 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSPAN19P0C672 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSPAN19P0C672 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN19P0C672 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN19P0C672 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN19P0C672 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN19P0C672 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN19P0C672 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN19P0C672 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN19P0C672 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN19P0C672 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN19P0C672 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN19P0C672 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN19P0C672 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN19P0C672 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN19P0C672 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSPAN19P0C672 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSPAN19P0C672 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSPAN19P0C672 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSPAN19P0C672 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN19P0C672 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN19P0C672 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN19P0C672 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN19P0C672 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TSPAN19P0C672 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN19P0C672 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSPAN19P0C672 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN19P0C672 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSPAN19P0C672 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSPAN19P0C672 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSPAN19P0C672 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN19P0C672 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN19P0C672 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSPAN19P0C672 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN19P0C672 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSPAN19P0C672 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSPAN19P0C672 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSPAN19P0C672 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSPAN19P0C672 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSPAN19P0C672 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN19P0C672 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN19P0C672 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSPAN19P0C672 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN19P0C672 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN19P0C672 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN19P0C672 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN19P0C672 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN19P0C672 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN19P0C672 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN19P0C672 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TSPAN19P0C672 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN19P0C672 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN19P0C672 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN19P0C672 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN19P0C672 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSPAN19P0C672 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN19P0C672 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN19P0C672 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN19P0C672 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN19P0C672 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN19P0C672 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN19P0C672 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSPAN19P0C672 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN19P0C672 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN19P0C672 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN19P0C672 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN19P0C672 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN19P0C672 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN19P0C672 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN19P0C672 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN19P0C672 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN19P0C672 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN19P0C672 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN19P0C672 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN19P0C672 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN19P0C672 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN19P0C672 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN19P0C672 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN19P0C672 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN19P0C672 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN19P0C672 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN19P0C672 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSPAN19P0C672 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSPAN19P0C672 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN19P0C672 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN19P0C672 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN19P0C672 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN19P0C672 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN19P0C672 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN19P0C672 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN19P0C672 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN19P0C672 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN19P0C672 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSPAN19P0C672 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSPAN19P0C672 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN19P0C672 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN19P0C672 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN19P0C672 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN19P0C672 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms