Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Z0

H2AFB2, Histone H2A-Bbd type 2/3, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFB2P0C5Z0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFB2P0C5Z0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2AFB2P0C5Z0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFB2P0C5Z0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFB2P0C5Z0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFB2P0C5Z0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2AFB2P0C5Z0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2AFB2P0C5Z0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFB2P0C5Z0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFB2P0C5Z0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFB2P0C5Z0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFB2P0C5Z0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFB2P0C5Z0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFB2P0C5Z0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFB2P0C5Z0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFB2P0C5Z0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFB2P0C5Z0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H2AFB2P0C5Z0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2AFB2P0C5Z0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2AFB2P0C5Z0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFB2P0C5Z0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFB2P0C5Z0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFB2P0C5Z0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFB2P0C5Z0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFB2P0C5Z0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2AFB2P0C5Z0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2AFB2P0C5Z0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2AFB2P0C5Z0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2AFB2P0C5Z0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2AFB2P0C5Z0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2AFB2P0C5Z0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2AFB2P0C5Z0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2AFB2P0C5Z0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFB2P0C5Z0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFB2P0C5Z0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2AFB2P0C5Z0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFB2P0C5Z0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFB2P0C5Z0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFB2P0C5Z0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFB2P0C5Z0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFB2P0C5Z0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFB2P0C5Z0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFB2P0C5Z0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFB2P0C5Z0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFB2P0C5Z0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFB2P0C5Z0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFB2P0C5Z0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFB2P0C5Z0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFB2P0C5Z0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFB2P0C5Z0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFB2P0C5Z0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFB2P0C5Z0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFB2P0C5Z0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFB2P0C5Z0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFB2P0C5Z0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFB2P0C5Z0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFB2P0C5Z0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFB2P0C5Z0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFB2P0C5Z0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFB2P0C5Z0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFB2P0C5Z0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
H2AFB2P0C5Z0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H2AFB2P0C5Z0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFB2P0C5Z0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFB2P0C5Z0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFB2P0C5Z0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFB2P0C5Z0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFB2P0C5Z0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFB2P0C5Z0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFB2P0C5Z0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFB2P0C5Z0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFB2P0C5Z0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFB2P0C5Z0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFB2P0C5Z0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2AFB2P0C5Z0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFB2P0C5Z0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFB2P0C5Z0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFB2P0C5Z0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFB2P0C5Z0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFB2P0C5Z0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFB2P0C5Z0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFB2P0C5Z0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2AFB2P0C5Z0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2AFB2P0C5Z0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2AFB2P0C5Z0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFB2P0C5Z0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFB2P0C5Z0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2AFB2P0C5Z0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2AFB2P0C5Z0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2AFB2P0C5Z0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
H2AFB2P0C5Z0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFB2P0C5Z0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2AFB2P0C5Z0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H2AFB2P0C5Z0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2AFB2P0C5Z0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2AFB2P0C5Z0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2AFB2P0C5Z0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2AFB2P0C5Z0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFB2P0C5Z0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2AFB2P0C5Z0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms