Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-AP01891 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-AP01891 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-AP01891 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-AP01891 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-AP01891 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-AP01891 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-AP01891 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-AP01891 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-AP01891 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-AP01891 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-AP01891 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-AP01891 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-AP01891 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-AP01891 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-AP01891 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-AP01891 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-AP01891 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-AP01891 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-AP01891 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HLA-AP01891 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-AP01891 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-AP01891 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-AP01891 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-AP01891 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-AP01891 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-AP01891 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-AP01891 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-AP01891 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-AP01891 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-AP01891 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-AP01891 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-AP01891 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-AP01891 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-AP01891 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-AP01891 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-AP01891 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-AP01891 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-AP01891 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-AP01891 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-AP01891 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-AP01891 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-AP01891 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-AP01891 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-AP01891 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-AP01891 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-AP01891 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-AP01891 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-AP01891 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-AP01891 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-AP01891 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-AP01891 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-AP01891 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-AP01891 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-AP01891 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-AP01891 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-AP01891 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-AP01891 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HLA-AP01891 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-AP01891 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-AP01891 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-AP01891 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-AP01891 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-AP01891 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-AP01891 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-AP01891 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-AP01891 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HLA-AP01891 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-AP01891 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-AP01891 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-AP01891 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-AP01891 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-AP01891 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-AP01891 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLA-AP01891 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-AP01891 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-AP01891 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-AP01891 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-AP01891 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-AP01891 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-AP01891 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-AP01891 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-AP01891 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-AP01891 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-AP01891 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-AP01891 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-AP01891 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-AP01891 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-AP01891 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-AP01891 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-AP01891 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-AP01891 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-AP01891 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-AP01891 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-AP01891 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-AP01891 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-AP01891 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-AP01891 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-AP01891 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-AP01891 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms