Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALX3O95076 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALX3O95076 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALX3O95076 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALX3O95076 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALX3O95076 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALX3O95076 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALX3O95076 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALX3O95076 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALX3O95076 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALX3O95076 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALX3O95076 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALX3O95076 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALX3O95076 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALX3O95076 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALX3O95076 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX3O95076 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ALX3O95076 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ALX3O95076 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALX3O95076 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALX3O95076 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALX3O95076 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALX3O95076 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX3O95076 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALX3O95076 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALX3O95076 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALX3O95076 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALX3O95076 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALX3O95076 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALX3O95076 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALX3O95076 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALX3O95076 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALX3O95076 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALX3O95076 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ALX3O95076 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALX3O95076 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALX3O95076 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALX3O95076 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALX3O95076 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALX3O95076 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALX3O95076 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALX3O95076 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALX3O95076 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALX3O95076 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALX3O95076 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALX3O95076 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALX3O95076 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALX3O95076 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALX3O95076 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALX3O95076 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALX3O95076 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALX3O95076 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALX3O95076 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALX3O95076 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALX3O95076 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALX3O95076 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALX3O95076 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALX3O95076 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALX3O95076 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX3O95076 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALX3O95076 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALX3O95076 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALX3O95076 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALX3O95076 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALX3O95076 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALX3O95076 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALX3O95076 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALX3O95076 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALX3O95076 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALX3O95076 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALX3O95076 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALX3O95076 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX3O95076 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX3O95076 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX3O95076 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALX3O95076 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALX3O95076 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALX3O95076 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALX3O95076 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX3O95076 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX3O95076 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALX3O95076 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALX3O95076 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALX3O95076 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALX3O95076 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALX3O95076 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALX3O95076 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX3O95076 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX3O95076 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX3O95076 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX3O95076 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALX3O95076 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALX3O95076 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALX3O95076 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALX3O95076 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALX3O95076 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALX3O95076 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALX3O95076 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALX3O95076 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALX3O95076 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms