Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SEC31AO94979 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SEC31AO94979 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SEC31AO94979 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SEC31AO94979 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SEC31AO94979 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SEC31AO94979 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SEC31AO94979 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SEC31AO94979 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SEC31AO94979 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SEC31AO94979 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SEC31AO94979 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SEC31AO94979 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SEC31AO94979 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SEC31AO94979 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SEC31AO94979 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SEC31AO94979 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SEC31AO94979 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SEC31AO94979 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SEC31AO94979 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SEC31AO94979 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SEC31AO94979 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SEC31AO94979 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SEC31AO94979 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SEC31AO94979 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SEC31AO94979 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEC31AO94979 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SEC31AO94979 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SEC31AO94979 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SEC31AO94979 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SEC31AO94979 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SEC31AO94979 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEC31AO94979 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC31AO94979 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC31AO94979 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC31AO94979 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SEC31AO94979 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SEC31AO94979 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SEC31AO94979 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SEC31AO94979 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEC31AO94979 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC31AO94979 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SEC31AO94979 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEC31AO94979 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEC31AO94979 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SEC31AO94979 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SEC31AO94979 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEC31AO94979 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEC31AO94979 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEC31AO94979 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEC31AO94979 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEC31AO94979 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEC31AO94979 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEC31AO94979 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SEC31AO94979 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SEC31AO94979 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEC31AO94979 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SEC31AO94979 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEC31AO94979 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEC31AO94979 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEC31AO94979 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEC31AO94979 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEC31AO94979 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SEC31AO94979 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SEC31AO94979 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SEC31AO94979 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SEC31AO94979 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEC31AO94979 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SEC31AO94979 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SEC31AO94979 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SEC31AO94979 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SEC31AO94979 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC31AO94979 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEC31AO94979 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEC31AO94979 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEC31AO94979 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEC31AO94979 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SEC31AO94979 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEC31AO94979 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SEC31AO94979 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SEC31AO94979 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SEC31AO94979 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEC31AO94979 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEC31AO94979 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEC31AO94979 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEC31AO94979 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEC31AO94979 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEC31AO94979 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SEC31AO94979 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SEC31AO94979 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SEC31AO94979 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SEC31AO94979 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SEC31AO94979 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SEC31AO94979 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SEC31AO94979 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SEC31AO94979 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEC31AO94979 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEC31AO94979 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEC31AO94979 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SEC31AO94979 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms