Protein–RNA interactions for Protein: O75920

SERF1A, Small EDRK-rich factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1AO75920 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERF1AO75920 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERF1AO75920 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SERF1AO75920 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERF1AO75920 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERF1AO75920 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERF1AO75920 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERF1AO75920 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERF1AO75920 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERF1AO75920 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERF1AO75920 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SERF1AO75920 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SERF1AO75920 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SERF1AO75920 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERF1AO75920 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERF1AO75920 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SERF1AO75920 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERF1AO75920 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SERF1AO75920 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERF1AO75920 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERF1AO75920 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERF1AO75920 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERF1AO75920 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERF1AO75920 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERF1AO75920 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERF1AO75920 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERF1AO75920 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERF1AO75920 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERF1AO75920 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SERF1AO75920 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERF1AO75920 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERF1AO75920 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERF1AO75920 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERF1AO75920 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERF1AO75920 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERF1AO75920 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SERF1AO75920 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERF1AO75920 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERF1AO75920 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERF1AO75920 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERF1AO75920 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SERF1AO75920 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERF1AO75920 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERF1AO75920 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERF1AO75920 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SERF1AO75920 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERF1AO75920 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERF1AO75920 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERF1AO75920 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERF1AO75920 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERF1AO75920 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERF1AO75920 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERF1AO75920 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERF1AO75920 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERF1AO75920 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERF1AO75920 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERF1AO75920 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERF1AO75920 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERF1AO75920 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERF1AO75920 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERF1AO75920 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERF1AO75920 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERF1AO75920 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERF1AO75920 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERF1AO75920 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERF1AO75920 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERF1AO75920 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERF1AO75920 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERF1AO75920 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERF1AO75920 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERF1AO75920 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERF1AO75920 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SERF1AO75920 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERF1AO75920 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERF1AO75920 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERF1AO75920 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SERF1AO75920 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SERF1AO75920 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERF1AO75920 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERF1AO75920 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERF1AO75920 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERF1AO75920 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERF1AO75920 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERF1AO75920 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERF1AO75920 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERF1AO75920 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERF1AO75920 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERF1AO75920 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERF1AO75920 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERF1AO75920 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERF1AO75920 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERF1AO75920 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERF1AO75920 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERF1AO75920 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERF1AO75920 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERF1AO75920 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERF1AO75920 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERF1AO75920 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERF1AO75920 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SERF1AO75920 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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