Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNKO75909 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNKO75909 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNKO75909 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNKO75909 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNKO75909 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNKO75909 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNKO75909 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNKO75909 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNKO75909 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNKO75909 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNKO75909 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNKO75909 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNKO75909 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNKO75909 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNKO75909 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNKO75909 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNKO75909 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNKO75909 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNKO75909 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNKO75909 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNKO75909 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNKO75909 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNKO75909 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNKO75909 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNKO75909 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCNKO75909 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNKO75909 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNKO75909 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNKO75909 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNKO75909 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNKO75909 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNKO75909 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNKO75909 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNKO75909 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNKO75909 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCNKO75909 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNKO75909 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNKO75909 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNKO75909 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNKO75909 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNKO75909 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNKO75909 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNKO75909 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNKO75909 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNKO75909 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNKO75909 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNKO75909 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNKO75909 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNKO75909 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNKO75909 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCNKO75909 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNKO75909 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNKO75909 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNKO75909 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNKO75909 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNKO75909 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNKO75909 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNKO75909 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNKO75909 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNKO75909 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNKO75909 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNKO75909 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNKO75909 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNKO75909 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNKO75909 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNKO75909 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNKO75909 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNKO75909 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNKO75909 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNKO75909 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNKO75909 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNKO75909 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNKO75909 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNKO75909 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNKO75909 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNKO75909 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNKO75909 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNKO75909 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNKO75909 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNKO75909 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNKO75909 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNKO75909 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNKO75909 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNKO75909 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNKO75909 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNKO75909 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNKO75909 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNKO75909 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNKO75909 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNKO75909 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNKO75909 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNKO75909 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNKO75909 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNKO75909 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNKO75909 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNKO75909 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNKO75909 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNKO75909 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNKO75909 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms