Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM24O75264 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMIM24O75264 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMIM24O75264 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMIM24O75264 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM24O75264 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMIM24O75264 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMIM24O75264 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM24O75264 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM24O75264 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMIM24O75264 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMIM24O75264 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM24O75264 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM24O75264 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMIM24O75264 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM24O75264 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM24O75264 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMIM24O75264 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMIM24O75264 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMIM24O75264 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMIM24O75264 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMIM24O75264 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM24O75264 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMIM24O75264 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMIM24O75264 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMIM24O75264 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMIM24O75264 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMIM24O75264 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMIM24O75264 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMIM24O75264 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMIM24O75264 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMIM24O75264 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMIM24O75264 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM24O75264 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM24O75264 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM24O75264 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM24O75264 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMIM24O75264 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMIM24O75264 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM24O75264 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMIM24O75264 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM24O75264 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM24O75264 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM24O75264 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM24O75264 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM24O75264 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM24O75264 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMIM24O75264 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMIM24O75264 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMIM24O75264 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMIM24O75264 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMIM24O75264 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMIM24O75264 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMIM24O75264 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMIM24O75264 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMIM24O75264 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMIM24O75264 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM24O75264 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM24O75264 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM24O75264 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM24O75264 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMIM24O75264 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMIM24O75264 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMIM24O75264 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMIM24O75264 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMIM24O75264 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM24O75264 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM24O75264 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMIM24O75264 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMIM24O75264 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM24O75264 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM24O75264 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMIM24O75264 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SMIM24O75264 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMIM24O75264 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM24O75264 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMIM24O75264 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMIM24O75264 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMIM24O75264 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMIM24O75264 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMIM24O75264 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMIM24O75264 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM24O75264 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMIM24O75264 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMIM24O75264 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMIM24O75264 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM24O75264 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM24O75264 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM24O75264 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM24O75264 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM24O75264 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM24O75264 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SMIM24O75264 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM24O75264 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM24O75264 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SMIM24O75264 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMIM24O75264 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMIM24O75264 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM24O75264 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM24O75264 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms