Protein–RNA interactions for Protein: O43309

ZSCAN12, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN12O43309 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZSCAN12O43309 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZSCAN12O43309 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZSCAN12O43309 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZSCAN12O43309 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZSCAN12O43309 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZSCAN12O43309 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
ZSCAN12O43309 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZSCAN12O43309 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZSCAN12O43309 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZSCAN12O43309 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ZSCAN12O43309 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ZSCAN12O43309 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZSCAN12O43309 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZSCAN12O43309 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZSCAN12O43309 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZSCAN12O43309 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ZSCAN12O43309 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ZSCAN12O43309 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZSCAN12O43309 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZSCAN12O43309 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZSCAN12O43309 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZSCAN12O43309 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZSCAN12O43309 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZSCAN12O43309 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZSCAN12O43309 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ZSCAN12O43309 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZSCAN12O43309 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZSCAN12O43309 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZSCAN12O43309 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZSCAN12O43309 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZSCAN12O43309 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZSCAN12O43309 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZSCAN12O43309 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZSCAN12O43309 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZSCAN12O43309 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZSCAN12O43309 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZSCAN12O43309 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZSCAN12O43309 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZSCAN12O43309 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZSCAN12O43309 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZSCAN12O43309 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ZSCAN12O43309 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ZSCAN12O43309 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZSCAN12O43309 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZSCAN12O43309 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZSCAN12O43309 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZSCAN12O43309 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZSCAN12O43309 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZSCAN12O43309 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZSCAN12O43309 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZSCAN12O43309 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZSCAN12O43309 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZSCAN12O43309 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZSCAN12O43309 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ZSCAN12O43309 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ZSCAN12O43309 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZSCAN12O43309 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZSCAN12O43309 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZSCAN12O43309 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZSCAN12O43309 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZSCAN12O43309 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZSCAN12O43309 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZSCAN12O43309 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZSCAN12O43309 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZSCAN12O43309 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZSCAN12O43309 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZSCAN12O43309 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZSCAN12O43309 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZSCAN12O43309 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZSCAN12O43309 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZSCAN12O43309 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZSCAN12O43309 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZSCAN12O43309 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZSCAN12O43309 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZSCAN12O43309 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZSCAN12O43309 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ZSCAN12O43309 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ZSCAN12O43309 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZSCAN12O43309 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZSCAN12O43309 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZSCAN12O43309 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZSCAN12O43309 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZSCAN12O43309 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZSCAN12O43309 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZSCAN12O43309 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZSCAN12O43309 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZSCAN12O43309 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZSCAN12O43309 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZSCAN12O43309 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZSCAN12O43309 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZSCAN12O43309 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZSCAN12O43309 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZSCAN12O43309 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZSCAN12O43309 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZSCAN12O43309 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZSCAN12O43309 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZSCAN12O43309 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZSCAN12O43309 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZSCAN12O43309 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms