Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DIRC3C9JPN6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DIRC3C9JPN6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DIRC3C9JPN6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DIRC3C9JPN6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DIRC3C9JPN6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DIRC3C9JPN6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DIRC3C9JPN6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DIRC3C9JPN6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DIRC3C9JPN6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DIRC3C9JPN6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DIRC3C9JPN6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DIRC3C9JPN6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DIRC3C9JPN6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DIRC3C9JPN6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DIRC3C9JPN6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DIRC3C9JPN6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DIRC3C9JPN6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DIRC3C9JPN6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DIRC3C9JPN6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DIRC3C9JPN6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DIRC3C9JPN6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DIRC3C9JPN6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DIRC3C9JPN6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DIRC3C9JPN6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DIRC3C9JPN6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DIRC3C9JPN6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DIRC3C9JPN6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DIRC3C9JPN6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DIRC3C9JPN6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DIRC3C9JPN6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DIRC3C9JPN6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DIRC3C9JPN6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DIRC3C9JPN6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DIRC3C9JPN6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DIRC3C9JPN6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DIRC3C9JPN6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DIRC3C9JPN6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DIRC3C9JPN6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DIRC3C9JPN6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DIRC3C9JPN6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DIRC3C9JPN6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DIRC3C9JPN6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DIRC3C9JPN6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DIRC3C9JPN6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DIRC3C9JPN6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DIRC3C9JPN6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DIRC3C9JPN6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DIRC3C9JPN6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DIRC3C9JPN6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DIRC3C9JPN6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DIRC3C9JPN6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DIRC3C9JPN6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DIRC3C9JPN6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DIRC3C9JPN6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DIRC3C9JPN6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DIRC3C9JPN6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DIRC3C9JPN6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DIRC3C9JPN6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DIRC3C9JPN6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DIRC3C9JPN6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DIRC3C9JPN6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DIRC3C9JPN6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DIRC3C9JPN6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DIRC3C9JPN6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DIRC3C9JPN6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DIRC3C9JPN6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DIRC3C9JPN6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DIRC3C9JPN6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DIRC3C9JPN6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DIRC3C9JPN6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DIRC3C9JPN6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DIRC3C9JPN6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DIRC3C9JPN6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DIRC3C9JPN6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DIRC3C9JPN6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DIRC3C9JPN6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DIRC3C9JPN6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DIRC3C9JPN6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DIRC3C9JPN6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DIRC3C9JPN6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DIRC3C9JPN6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DIRC3C9JPN6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DIRC3C9JPN6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DIRC3C9JPN6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DIRC3C9JPN6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DIRC3C9JPN6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DIRC3C9JPN6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DIRC3C9JPN6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DIRC3C9JPN6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DIRC3C9JPN6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DIRC3C9JPN6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DIRC3C9JPN6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DIRC3C9JPN6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DIRC3C9JPN6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DIRC3C9JPN6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DIRC3C9JPN6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DIRC3C9JPN6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DIRC3C9JPN6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DIRC3C9JPN6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms