Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGPEP1LA6NFU8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGPEP1LA6NFU8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGPEP1LA6NFU8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGPEP1LA6NFU8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGPEP1LA6NFU8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGPEP1LA6NFU8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGPEP1LA6NFU8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGPEP1LA6NFU8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGPEP1LA6NFU8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGPEP1LA6NFU8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PGPEP1LA6NFU8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGPEP1LA6NFU8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGPEP1LA6NFU8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGPEP1LA6NFU8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGPEP1LA6NFU8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGPEP1LA6NFU8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGPEP1LA6NFU8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGPEP1LA6NFU8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGPEP1LA6NFU8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGPEP1LA6NFU8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGPEP1LA6NFU8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGPEP1LA6NFU8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGPEP1LA6NFU8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGPEP1LA6NFU8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGPEP1LA6NFU8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGPEP1LA6NFU8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGPEP1LA6NFU8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGPEP1LA6NFU8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGPEP1LA6NFU8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGPEP1LA6NFU8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGPEP1LA6NFU8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGPEP1LA6NFU8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGPEP1LA6NFU8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGPEP1LA6NFU8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PGPEP1LA6NFU8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGPEP1LA6NFU8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGPEP1LA6NFU8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGPEP1LA6NFU8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGPEP1LA6NFU8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PGPEP1LA6NFU8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGPEP1LA6NFU8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGPEP1LA6NFU8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGPEP1LA6NFU8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGPEP1LA6NFU8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGPEP1LA6NFU8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGPEP1LA6NFU8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGPEP1LA6NFU8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGPEP1LA6NFU8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGPEP1LA6NFU8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGPEP1LA6NFU8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGPEP1LA6NFU8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGPEP1LA6NFU8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGPEP1LA6NFU8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGPEP1LA6NFU8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGPEP1LA6NFU8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGPEP1LA6NFU8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGPEP1LA6NFU8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGPEP1LA6NFU8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGPEP1LA6NFU8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGPEP1LA6NFU8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGPEP1LA6NFU8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGPEP1LA6NFU8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGPEP1LA6NFU8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGPEP1LA6NFU8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGPEP1LA6NFU8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGPEP1LA6NFU8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGPEP1LA6NFU8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGPEP1LA6NFU8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGPEP1LA6NFU8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGPEP1LA6NFU8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGPEP1LA6NFU8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGPEP1LA6NFU8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PGPEP1LA6NFU8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGPEP1LA6NFU8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGPEP1LA6NFU8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGPEP1LA6NFU8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGPEP1LA6NFU8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGPEP1LA6NFU8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGPEP1LA6NFU8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGPEP1LA6NFU8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGPEP1LA6NFU8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PGPEP1LA6NFU8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGPEP1LA6NFU8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGPEP1LA6NFU8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGPEP1LA6NFU8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGPEP1LA6NFU8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGPEP1LA6NFU8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGPEP1LA6NFU8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGPEP1LA6NFU8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGPEP1LA6NFU8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGPEP1LA6NFU8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGPEP1LA6NFU8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGPEP1LA6NFU8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGPEP1LA6NFU8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGPEP1LA6NFU8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGPEP1LA6NFU8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGPEP1LA6NFU8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGPEP1LA6NFU8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms