Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC35F4A4IF30 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC35F4A4IF30 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC35F4A4IF30 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC35F4A4IF30 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC35F4A4IF30 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC35F4A4IF30 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC35F4A4IF30 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC35F4A4IF30 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC35F4A4IF30 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC35F4A4IF30 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC35F4A4IF30 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC35F4A4IF30 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC35F4A4IF30 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC35F4A4IF30 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC35F4A4IF30 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC35F4A4IF30 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC35F4A4IF30 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC35F4A4IF30 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC35F4A4IF30 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC35F4A4IF30 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC35F4A4IF30 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC35F4A4IF30 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC35F4A4IF30 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC35F4A4IF30 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC35F4A4IF30 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC35F4A4IF30 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC35F4A4IF30 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC35F4A4IF30 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC35F4A4IF30 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC35F4A4IF30 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC35F4A4IF30 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC35F4A4IF30 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC35F4A4IF30 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC35F4A4IF30 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC35F4A4IF30 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC35F4A4IF30 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC35F4A4IF30 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC35F4A4IF30 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC35F4A4IF30 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC35F4A4IF30 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC35F4A4IF30 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC35F4A4IF30 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC35F4A4IF30 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC35F4A4IF30 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC35F4A4IF30 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC35F4A4IF30 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC35F4A4IF30 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC35F4A4IF30 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC35F4A4IF30 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC35F4A4IF30 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC35F4A4IF30 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC35F4A4IF30 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC35F4A4IF30 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC35F4A4IF30 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC35F4A4IF30 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC35F4A4IF30 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC35F4A4IF30 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC35F4A4IF30 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC35F4A4IF30 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC35F4A4IF30 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC35F4A4IF30 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC35F4A4IF30 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC35F4A4IF30 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC35F4A4IF30 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC35F4A4IF30 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC35F4A4IF30 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC35F4A4IF30 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC35F4A4IF30 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC35F4A4IF30 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC35F4A4IF30 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC35F4A4IF30 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC35F4A4IF30 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC35F4A4IF30 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC35F4A4IF30 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC35F4A4IF30 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC35F4A4IF30 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC35F4A4IF30 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC35F4A4IF30 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC35F4A4IF30 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC35F4A4IF30 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC35F4A4IF30 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC35F4A4IF30 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC35F4A4IF30 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC35F4A4IF30 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC35F4A4IF30 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC35F4A4IF30 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC35F4A4IF30 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC35F4A4IF30 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC35F4A4IF30 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC35F4A4IF30 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC35F4A4IF30 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC35F4A4IF30 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC35F4A4IF30 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC35F4A4IF30 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC35F4A4IF30 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC35F4A4IF30 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC35F4A4IF30 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC35F4A4IF30 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC35F4A4IF30 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms