Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRBV5-3A0A0A0MS03 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRBV5-3A0A0A0MS03 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRBV5-3A0A0A0MS03 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRBV5-3A0A0A0MS03 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRBV5-3A0A0A0MS03 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRBV5-3A0A0A0MS03 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRBV5-3A0A0A0MS03 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRBV5-3A0A0A0MS03 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRBV5-3A0A0A0MS03 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRBV5-3A0A0A0MS03 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRBV5-3A0A0A0MS03 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRBV5-3A0A0A0MS03 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRBV5-3A0A0A0MS03 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRBV5-3A0A0A0MS03 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRBV5-3A0A0A0MS03 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRBV5-3A0A0A0MS03 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRBV5-3A0A0A0MS03 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRBV5-3A0A0A0MS03 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRBV5-3A0A0A0MS03 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRBV5-3A0A0A0MS03 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRBV5-3A0A0A0MS03 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRBV5-3A0A0A0MS03 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRBV5-3A0A0A0MS03 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRBV5-3A0A0A0MS03 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRBV5-3A0A0A0MS03 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRBV5-3A0A0A0MS03 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRBV5-3A0A0A0MS03 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRBV5-3A0A0A0MS03 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRBV5-3A0A0A0MS03 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRBV5-3A0A0A0MS03 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRBV5-3A0A0A0MS03 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRBV5-3A0A0A0MS03 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRBV5-3A0A0A0MS03 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRBV5-3A0A0A0MS03 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRBV5-3A0A0A0MS03 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRBV5-3A0A0A0MS03 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRBV5-3A0A0A0MS03 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRBV5-3A0A0A0MS03 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRBV5-3A0A0A0MS03 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRBV5-3A0A0A0MS03 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRBV5-3A0A0A0MS03 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRBV5-3A0A0A0MS03 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRBV5-3A0A0A0MS03 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRBV5-3A0A0A0MS03 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRBV5-3A0A0A0MS03 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRBV5-3A0A0A0MS03 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRBV5-3A0A0A0MS03 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRBV5-3A0A0A0MS03 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRBV5-3A0A0A0MS03 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRBV5-3A0A0A0MS03 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRBV5-3A0A0A0MS03 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRBV5-3A0A0A0MS03 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRBV5-3A0A0A0MS03 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRBV5-3A0A0A0MS03 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRBV5-3A0A0A0MS03 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRBV5-3A0A0A0MS03 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRBV5-3A0A0A0MS03 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRBV5-3A0A0A0MS03 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRBV5-3A0A0A0MS03 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms