Protein–RNA interactions for Protein: A0A088AWK7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A088AWK7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
A0A088AWK7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
A0A088AWK7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A088AWK7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A088AWK7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
A0A088AWK7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A088AWK7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A088AWK7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A088AWK7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A088AWK7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A088AWK7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A088AWK7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A088AWK7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A088AWK7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A088AWK7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A088AWK7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A088AWK7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A088AWK7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A088AWK7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A088AWK7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A088AWK7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A088AWK7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A088AWK7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A088AWK7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A088AWK7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A088AWK7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A088AWK7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A088AWK7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A088AWK7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A088AWK7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A088AWK7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A088AWK7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A088AWK7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A088AWK7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A088AWK7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A088AWK7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A088AWK7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A088AWK7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A088AWK7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A088AWK7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A088AWK7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A088AWK7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A088AWK7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A088AWK7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A088AWK7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A088AWK7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A088AWK7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A088AWK7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A088AWK7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A088AWK7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A088AWK7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
A0A088AWK7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
A0A088AWK7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A088AWK7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A088AWK7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A088AWK7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A088AWK7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A088AWK7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A088AWK7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A088AWK7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A088AWK7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A088AWK7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A088AWK7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A088AWK7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A088AWK7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A088AWK7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A088AWK7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A088AWK7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A088AWK7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A088AWK7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
A0A088AWK7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A0A088AWK7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A0A088AWK7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
A0A088AWK7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A088AWK7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A088AWK7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A088AWK7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A088AWK7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A088AWK7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A088AWK7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A088AWK7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A088AWK7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A088AWK7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A088AWK7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A088AWK7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A088AWK7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A088AWK7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A088AWK7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A088AWK7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A088AWK7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A088AWK7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A088AWK7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A088AWK7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A088AWK7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A088AWK7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A088AWK7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A088AWK7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A088AWK7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A088AWK7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A088AWK7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms