Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DCLK3Q9C098 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DCLK3Q9C098 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCLK3Q9C098 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCLK3Q9C098 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms