RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638187.1

REST-210, Transcript of RE1 silencing transcription factor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene REST, Length 1,334 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REST-210ENST00000638187 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.53■■■■■ 7.12
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REST-210ENST00000638187 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.91■■■■■ 5.58
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REST-210ENST00000638187 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.59■■■■■ 5.53
REST-210ENST00000638187 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.55■■■■■ 5.52
REST-210ENST00000638187 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.32■■■■■ 5.49
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REST-210ENST00000638187 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.55■■■■■ 5.04
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REST-210ENST00000638187 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.08■■■■■ 4.65
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REST-210ENST00000638187 TOPBP1Q92547 1522 aa43.37■■■■■ 4.53
REST-210ENST00000638187 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.37■■■■■ 4.53
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REST-210ENST00000638187 CUX1P39880 1505 aa43■■■■■ 4.47
REST-210ENST00000638187 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
REST-210ENST00000638187 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.9■■■■■ 4.46
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REST-210ENST00000638187 TOP2BQ02880 1626 aa42.7■■■■■ 4.43
REST-210ENST00000638187 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.7■■■■■ 4.43
REST-210ENST00000638187 WDR97A6NE52 1622 aa42.69■■■■■ 4.42
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REST-210ENST00000638187 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.61■■■■■ 4.41
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REST-210ENST00000638187 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.51■■■■■ 4.4
REST-210ENST00000638187 OSCARQ8IYS5 282 aa42.4■■■■■ 4.38
REST-210ENST00000638187 GRIN2BQ13224 1484 aa42.38■■■■■ 4.37
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REST-210ENST00000638187 PBRM1Q86U86 1689 aa42.29■■■■■ 4.36
REST-210ENST00000638187 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.27■■■■■ 4.36
REST-210ENST00000638187 CHD1O14646 1710 aa42.22■■■■■ 4.35
REST-210ENST00000638187 FBLN2P98095 1184 aa42.2■■■■■ 4.35
REST-210ENST00000638187 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
REST-210ENST00000638187 SYNJ2O15056 1496 aa42.1■■■■■ 4.33
REST-210ENST00000638187 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.04■■■■■ 4.32
REST-210ENST00000638187 KIF27Q86VH2 1401 aa41.95■■■■■ 4.31
REST-210ENST00000638187 ADAMTS12P58397 1594 aa41.93■■■■■ 4.3
REST-210ENST00000638187 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.9■■■■■ 4.3
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REST-210ENST00000638187 GRIN2AQ12879 1464 aa41.81■■■■■ 4.28
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REST-210ENST00000638187 CUL7Q14999 1698 aa41.7■■■■■ 4.27
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REST-210ENST00000638187 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.66■■■■■ 4.26
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REST-210ENST00000638187 NUP160Q12769 1436 aa41.6■■■■■ 4.25
REST-210ENST00000638187 CEP170Q5SW79 1584 aa41.55■■■■■ 4.24
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REST-210ENST00000638187 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.38■■■■■ 4.21
REST-210ENST00000638187 SHROOM2Q13796 1616 aa41.29■■■■■ 4.2
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REST-210ENST00000638187 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.26■■■■■ 4.2
REST-210ENST00000638187 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.26■■■■■ 4.2
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