Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HERC5Q9UII4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HERC5Q9UII4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HERC5Q9UII4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
HERC5Q9UII4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HERC5Q9UII4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms