RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439424.6

C17orf49-201, Transcript of chromosome 17 open reading frame 49, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene C17orf49, Length 850 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf49-201ENST00000439424 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.35■■■■■ 7.09
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C17orf49-201ENST00000439424 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.99■■■■■ 5.59
C17orf49-201ENST00000439424 NACADO15069 1562 aa49.82■■■■■ 5.57
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C17orf49-201ENST00000439424 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.58■■■■■ 5.37
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C17orf49-201ENST00000439424 SCRIBQ14160 1630 aa48.38■■■■■ 5.34
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C17orf49-201ENST00000439424 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.89■■■■■ 5.26
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C17orf49-201ENST00000439424 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.82■■■■■ 5.09
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C17orf49-201ENST00000439424 NCAPD3P42695 1498 aa45.91■■■■■ 4.94
C17orf49-201ENST00000439424 SMARCA2P51531 1590 aa45.88■■■■■ 4.94
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C17orf49-201ENST00000439424 HMGXB3Q12766 1538 aa45.77■■■■■ 4.92
C17orf49-201ENST00000439424 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.71■■■■■ 4.91
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C17orf49-201ENST00000439424 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.86■■■■■ 4.77
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C17orf49-201ENST00000439424 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.64■■■■■ 4.74
C17orf49-201ENST00000439424 CUX2O14529 1486 aa44.54■■■■■ 4.72
C17orf49-201ENST00000439424 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.53■■■■■ 4.72
C17orf49-201ENST00000439424 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.52■■■■■ 4.72
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C17orf49-201ENST00000439424 PRDM2Q13029 1718 aa44.19■■■■■ 4.66
C17orf49-201ENST00000439424 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.18■■■■■ 4.66
C17orf49-201ENST00000439424 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.1■■■■■ 4.65
C17orf49-201ENST00000439424 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.09■■■■■ 4.65
C17orf49-201ENST00000439424 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.09■■■■■ 4.65
C17orf49-201ENST00000439424 WDR62O43379 1518 aa44.02■■■■■ 4.64
C17orf49-201ENST00000439424 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
C17orf49-201ENST00000439424 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.57
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C17orf49-201ENST00000439424 TOPBP1Q92547 1522 aa43.39■■■■■ 4.54
C17orf49-201ENST00000439424 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.34■■■■■ 4.53
C17orf49-201ENST00000439424 ABCC8Q09428 1581 aa43.24■■■■■ 4.51
C17orf49-201ENST00000439424 IFT140Q96RY7 1462 aa43.13■■■■■ 4.5
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C17orf49-201ENST00000439424 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
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C17orf49-201ENST00000439424 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.86■■■■■ 4.45
C17orf49-201ENST00000439424 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.81■■■■■ 4.44
C17orf49-201ENST00000439424 SOGA1O94964 1423 aa42.71■■■■■ 4.43
C17orf49-201ENST00000439424 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.7■■■■■ 4.43
C17orf49-201ENST00000439424 WDR97A6NE52 1622 aa42.69■■■■■ 4.42
C17orf49-201ENST00000439424 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.59■■■■■ 4.41
C17orf49-201ENST00000439424 CHD1O14646 1710 aa42.56■■■■■ 4.4
C17orf49-201ENST00000439424 SYNJ1O43426 1573 aa42.55■■■■■ 4.4
C17orf49-201ENST00000439424 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
C17orf49-201ENST00000439424 TOP2BQ02880 1626 aa42.53■■■■■ 4.4
C17orf49-201ENST00000439424 OSCARQ8IYS5 282 aa42.48■■■■■ 4.39
C17orf49-201ENST00000439424 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.47■■■■■ 4.39
C17orf49-201ENST00000439424 PBRM1Q86U86 1689 aa42.43■■■■■ 4.38
C17orf49-201ENST00000439424 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.39■■■■■ 4.38
C17orf49-201ENST00000439424 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.38■■■■■ 4.37
C17orf49-201ENST00000439424 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.36■■■■■ 4.37
C17orf49-201ENST00000439424 GRIN2BQ13224 1484 aa42.3■■■■■ 4.36
C17orf49-201ENST00000439424 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.27■■■■■ 4.36
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C17orf49-201ENST00000439424 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.13■■■■■ 4.34
C17orf49-201ENST00000439424 SYNJ2O15056 1496 aa42.08■■■■■ 4.33
C17orf49-201ENST00000439424 ARHGEF11O15085 1522 aa42.02■■■■■ 4.32
C17orf49-201ENST00000439424 ADAMTS12P58397 1594 aa41.99■■■■■ 4.31
C17orf49-201ENST00000439424 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.97■■■■■ 4.31
C17orf49-201ENST00000439424 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
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C17orf49-201ENST00000439424 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.88■■■■■ 4.29
C17orf49-201ENST00000439424 GRIN2AQ12879 1464 aa41.8■■■■■ 4.28
C17orf49-201ENST00000439424 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.73■■■■■ 4.27
C17orf49-201ENST00000439424 CEP170Q5SW79 1584 aa41.7■■■■■ 4.27
C17orf49-201ENST00000439424 ARAP1Q96P48 1450 aa41.67■■■■■ 4.26
C17orf49-201ENST00000439424 NUP160Q12769 1436 aa41.61■■■■■ 4.25
C17orf49-201ENST00000439424 KIF27Q86VH2 1401 aa41.57■■■■■ 4.25
C17orf49-201ENST00000439424 CUL7Q14999 1698 aa41.52■■■■■ 4.24
C17orf49-201ENST00000439424 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.47■■■■■ 4.23
C17orf49-201ENST00000439424 SHROOM2Q13796 1616 aa41.45■■■■■ 4.23
C17orf49-201ENST00000439424 IGF1RP08069 1367 aa41.42■■■■■ 4.22
C17orf49-201ENST00000439424 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.41■■■■■ 4.22
C17orf49-201ENST00000439424 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.39■■■■■ 4.22
C17orf49-201ENST00000439424 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.17■■■■■ 4.18
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