RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399676.3

KRTAP5-5-201, Transcript of keratin associated protein 5-5, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene KRTAP5-5, Length 933 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP5-5-201ENST00000399676 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.23■■■■■ 7.07
KRTAP5-5-201ENST00000399676 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.12■■■■■ 6.09
KRTAP5-5-201ENST00000399676 ABCC9O60706 1549 aa52.96■■■■■ 6.07
KRTAP5-5-201ENST00000399676 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.49■■■■■ 5.67
KRTAP5-5-201ENST00000399676 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.17■■■■■ 5.62
KRTAP5-5-201ENST00000399676 NACADO15069 1562 aa50.13■■■■■ 5.62
KRTAP5-5-201ENST00000399676 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.43■■■■■ 5.5
KRTAP5-5-201ENST00000399676 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.34■■■■■ 5.49
KRTAP5-5-201ENST00000399676 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.33■■■■■ 5.49
KRTAP5-5-201ENST00000399676 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.28■■■■■ 5.48
KRTAP5-5-201ENST00000399676 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.13■■■■■ 5.46
KRTAP5-5-201ENST00000399676 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.88■■■■■ 5.42
KRTAP5-5-201ENST00000399676 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.87■■■■■ 5.41
KRTAP5-5-201ENST00000399676 SCRIBQ14160 1630 aa48.52■■■■■ 5.36
KRTAP5-5-201ENST00000399676 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.27■■■■■ 5.32
KRTAP5-5-201ENST00000399676 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.81■■■■■ 5.24
KRTAP5-5-201ENST00000399676 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.75■■■■■ 5.23
KRTAP5-5-201ENST00000399676 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.65■■■■■ 5.22
KRTAP5-5-201ENST00000399676 SMARCA4P51532 1647 aa46.22■■■■■ 4.99
KRTAP5-5-201ENST00000399676 NCAPD3P42695 1498 aa46.19■■■■■ 4.99
KRTAP5-5-201ENST00000399676 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.14■■■■■ 4.98
KRTAP5-5-201ENST00000399676 SMARCA2P51531 1590 aa46.1■■■■■ 4.97
KRTAP5-5-201ENST00000399676 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.03■■■■■ 4.96
KRTAP5-5-201ENST00000399676 HMGXB3Q12766 1538 aa45.95■■■■■ 4.95
KRTAP5-5-201ENST00000399676 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.82■■■■■ 4.93
KRTAP5-5-201ENST00000399676 ERCC6Q03468 1493 aa45.8■■■■■ 4.92
KRTAP5-5-201ENST00000399676 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.66■■■■■ 4.9
KRTAP5-5-201ENST00000399676 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.65■■■■■ 4.9
KRTAP5-5-201ENST00000399676 NESP48681 1621 aa45.5■■■■■ 4.87
KRTAP5-5-201ENST00000399676 CUX2O14529 1486 aa45.49■■■■■ 4.87
KRTAP5-5-201ENST00000399676 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.24■■■■■ 4.83
KRTAP5-5-201ENST00000399676 WIZO95785 1651 aa45.19■■■■■ 4.83
KRTAP5-5-201ENST00000399676 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.14■■■■■ 4.82
KRTAP5-5-201ENST00000399676 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45■■■■■ 4.79
KRTAP5-5-201ENST00000399676 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
KRTAP5-5-201ENST00000399676 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.99■■■■■ 4.79
KRTAP5-5-201ENST00000399676 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.87■■■■■ 4.77
KRTAP5-5-201ENST00000399676 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.75■■■■■ 4.76
KRTAP5-5-201ENST00000399676 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.6■■■■■ 4.73
KRTAP5-5-201ENST00000399676 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.58■■■■■ 4.73
KRTAP5-5-201ENST00000399676 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.49■■■■■ 4.71
KRTAP5-5-201ENST00000399676 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.42■■■■■ 4.7
KRTAP5-5-201ENST00000399676 WDR62O43379 1518 aa44.42■■■■■ 4.7
KRTAP5-5-201ENST00000399676 CFTRP13569 1480 aa44.37■■■■■ 4.69
KRTAP5-5-201ENST00000399676 PRDM2Q13029 1718 aa44.11■■■■■ 4.65
KRTAP5-5-201ENST00000399676 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.07■■■■■ 4.65
KRTAP5-5-201ENST00000399676 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
KRTAP5-5-201ENST00000399676 TOPBP1Q92547 1522 aa43.58■■■■■ 4.57
KRTAP5-5-201ENST00000399676 IFT140Q96RY7 1462 aa43.55■■■■■ 4.56
KRTAP5-5-201ENST00000399676 ABCC8Q09428 1581 aa43.52■■■■■ 4.56
KRTAP5-5-201ENST00000399676 TRIM41Q8WV44 630 aa43.5■■■■■ 4.55
KRTAP5-5-201ENST00000399676 OSCARQ8IYS5 282 aa43.49■■■■■ 4.55
KRTAP5-5-201ENST00000399676 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.47■■■■■ 4.55
KRTAP5-5-201ENST00000399676 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.43■■■■■ 4.54
KRTAP5-5-201ENST00000399676 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
KRTAP5-5-201ENST00000399676 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
KRTAP5-5-201ENST00000399676 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
KRTAP5-5-201ENST00000399676 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.14■■■■■ 4.5
KRTAP5-5-201ENST00000399676 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.08■■■■■ 4.49
KRTAP5-5-201ENST00000399676 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43■■■■■ 4.47
KRTAP5-5-201ENST00000399676 SOGA1O94964 1423 aa42.98■■■■■ 4.47
KRTAP5-5-201ENST00000399676 CHD1O14646 1710 aa42.95■■■■■ 4.47
KRTAP5-5-201ENST00000399676 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.94■■■■■ 4.47
KRTAP5-5-201ENST00000399676 FBLN2P98095 1184 aa42.93■■■■■ 4.46
KRTAP5-5-201ENST00000399676 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.92■■■■■ 4.46
KRTAP5-5-201ENST00000399676 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.92■■■■■ 4.46
KRTAP5-5-201ENST00000399676 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.92■■■■■ 4.46
KRTAP5-5-201ENST00000399676 CUX1P39880 1505 aa42.89■■■■■ 4.46
KRTAP5-5-201ENST00000399676 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
KRTAP5-5-201ENST00000399676 ARHGEF11O15085 1522 aa42.77■■■■■ 4.44
KRTAP5-5-201ENST00000399676 WDR97A6NE52 1622 aa42.75■■■■■ 4.43
KRTAP5-5-201ENST00000399676 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.7■■■■■ 4.43
KRTAP5-5-201ENST00000399676 GRIN2BQ13224 1484 aa42.58■■■■■ 4.41
KRTAP5-5-201ENST00000399676 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
KRTAP5-5-201ENST00000399676 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
KRTAP5-5-201ENST00000399676 PBRM1Q86U86 1689 aa42.52■■■■■ 4.4
KRTAP5-5-201ENST00000399676 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.5■■■■■ 4.39
KRTAP5-5-201ENST00000399676 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.48■■■■■ 4.39
KRTAP5-5-201ENST00000399676 SYNJ1O43426 1573 aa42.45■■■■■ 4.39
KRTAP5-5-201ENST00000399676 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.41■■■■■ 4.38
KRTAP5-5-201ENST00000399676 SYNJ2O15056 1496 aa42.41■■■■■ 4.38
KRTAP5-5-201ENST00000399676 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.35■■■■■ 4.37
KRTAP5-5-201ENST00000399676 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.34■■■■■ 4.37
KRTAP5-5-201ENST00000399676 ARAP1Q96P48 1450 aa42.34■■■■■ 4.37
KRTAP5-5-201ENST00000399676 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.33■■■■■ 4.37
KRTAP5-5-201ENST00000399676 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.31■■■■■ 4.36
KRTAP5-5-201ENST00000399676 TOP2BQ02880 1626 aa42.29■■■■■ 4.36
KRTAP5-5-201ENST00000399676 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.08■■■■■ 4.33
KRTAP5-5-201ENST00000399676 ADAMTS12P58397 1594 aa42.06■■■■■ 4.32
KRTAP5-5-201ENST00000399676 GRIN2AQ12879 1464 aa42.03■■■■■ 4.32
KRTAP5-5-201ENST00000399676 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.93■■■■■ 4.3
KRTAP5-5-201ENST00000399676 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.91■■■■■ 4.3
KRTAP5-5-201ENST00000399676 CEP170Q5SW79 1584 aa41.87■■■■■ 4.29
KRTAP5-5-201ENST00000399676 NUP160Q12769 1436 aa41.8■■■■■ 4.28
KRTAP5-5-201ENST00000399676 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.71■■■■■ 4.27
KRTAP5-5-201ENST00000399676 SHROOM2Q13796 1616 aa41.62■■■■■ 4.25
KRTAP5-5-201ENST00000399676 KIF27Q86VH2 1401 aa41.52■■■■■ 4.24
KRTAP5-5-201ENST00000399676 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
KRTAP5-5-201ENST00000399676 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.45■■■■■ 4.23
KRTAP5-5-201ENST00000399676 JPH4Q96JJ6 628 aa41.44■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms