RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602959.5

UBE2E3-213, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene UBE2E3, Length 909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-213ENST00000602959 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.31■■■■■ 7.09
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UBE2E3-213ENST00000602959 NACADO15069 1562 aa49.71■■■■■ 5.55
UBE2E3-213ENST00000602959 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.41■■■■■ 5.5
UBE2E3-213ENST00000602959 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.41■■■■■ 5.5
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UBE2E3-213ENST00000602959 SMARCA2P51531 1590 aa45.81■■■■■ 4.92
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UBE2E3-213ENST00000602959 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.31■■■■■ 4.68
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UBE2E3-213ENST00000602959 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.97■■■■■ 4.63
UBE2E3-213ENST00000602959 PRDM2Q13029 1718 aa43.96■■■■■ 4.63
UBE2E3-213ENST00000602959 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.94■■■■■ 4.62
UBE2E3-213ENST00000602959 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.92■■■■■ 4.62
UBE2E3-213ENST00000602959 WDR62O43379 1518 aa43.83■■■■■ 4.61
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UBE2E3-213ENST00000602959 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.23■■■■■ 4.51
UBE2E3-213ENST00000602959 IFT140Q96RY7 1462 aa43.03■■■■■ 4.48
UBE2E3-213ENST00000602959 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.03■■■■■ 4.48
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UBE2E3-213ENST00000602959 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.53■■■■■ 4.4
UBE2E3-213ENST00000602959 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.52■■■■■ 4.4
UBE2E3-213ENST00000602959 TOP2BQ02880 1626 aa42.5■■■■■ 4.39
UBE2E3-213ENST00000602959 SYNJ1O43426 1573 aa42.47■■■■■ 4.39
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UBE2E3-213ENST00000602959 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.24■■■■■ 4.35
UBE2E3-213ENST00000602959 GRIN2BQ13224 1484 aa42.23■■■■■ 4.35
UBE2E3-213ENST00000602959 CHD1O14646 1710 aa42.22■■■■■ 4.35
UBE2E3-213ENST00000602959 PBRM1Q86U86 1689 aa42.19■■■■■ 4.34
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UBE2E3-213ENST00000602959 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.18■■■■■ 4.34
UBE2E3-213ENST00000602959 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.16■■■■■ 4.34
UBE2E3-213ENST00000602959 SYNJ2O15056 1496 aa41.98■■■■■ 4.31
UBE2E3-213ENST00000602959 FBLN2P98095 1184 aa41.98■■■■■ 4.31
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UBE2E3-213ENST00000602959 ADAMTS12P58397 1594 aa41.84■■■■■ 4.29
UBE2E3-213ENST00000602959 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.76■■■■■ 4.28
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UBE2E3-213ENST00000602959 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.76■■■■■ 4.28
UBE2E3-213ENST00000602959 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.76■■■■■ 4.28
UBE2E3-213ENST00000602959 ARHGEF11O15085 1522 aa41.72■■■■■ 4.27
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UBE2E3-213ENST00000602959 KIF27Q86VH2 1401 aa41.63■■■■■ 4.26
UBE2E3-213ENST00000602959 NUP160Q12769 1436 aa41.52■■■■■ 4.24
UBE2E3-213ENST00000602959 CEP170Q5SW79 1584 aa41.51■■■■■ 4.24
UBE2E3-213ENST00000602959 TRIM41Q8WV44 630 aa41.48■■■■■ 4.23
UBE2E3-213ENST00000602959 IGF1RP08069 1367 aa41.48■■■■■ 4.23
UBE2E3-213ENST00000602959 CUL7Q14999 1698 aa41.47■■■■■ 4.23
UBE2E3-213ENST00000602959 ARAP1Q96P48 1450 aa41.37■■■■■ 4.21
UBE2E3-213ENST00000602959 SHROOM2Q13796 1616 aa41.29■■■■■ 4.2
UBE2E3-213ENST00000602959 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.23■■■■■ 4.19
UBE2E3-213ENST00000602959 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.22■■■■■ 4.19
UBE2E3-213ENST00000602959 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.21■■■■■ 4.19
UBE2E3-213ENST00000602959 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.12■■■■■ 4.17
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