RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515045.1

AC139795.1-203, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC139795.1, Length 853 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC139795.1-203ENST00000515045 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.93■■■■■ 7.02
AC139795.1-203ENST00000515045 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.58■■■■■ 6.01
AC139795.1-203ENST00000515045 ABCC9O60706 1549 aa51.68■■■■■ 5.86
AC139795.1-203ENST00000515045 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.64■■■■■ 5.54
AC139795.1-203ENST00000515045 NACADO15069 1562 aa49.53■■■■■ 5.52
AC139795.1-203ENST00000515045 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.26■■■■■ 5.48
AC139795.1-203ENST00000515045 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.18■■■■■ 5.46
AC139795.1-203ENST00000515045 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.01■■■■■ 5.44
AC139795.1-203ENST00000515045 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.81■■■■■ 5.4
AC139795.1-203ENST00000515045 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.48■■■■■ 5.35
AC139795.1-203ENST00000515045 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.22■■■■■ 5.31
AC139795.1-203ENST00000515045 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.13■■■■■ 5.29
AC139795.1-203ENST00000515045 SCRIBQ14160 1630 aa47.84■■■■■ 5.25
AC139795.1-203ENST00000515045 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.76■■■■■ 5.24
AC139795.1-203ENST00000515045 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.71■■■■■ 5.23
AC139795.1-203ENST00000515045 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.9■■■■■ 5.1
AC139795.1-203ENST00000515045 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.78■■■■■ 5.08
AC139795.1-203ENST00000515045 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.52■■■■■ 5.04
AC139795.1-203ENST00000515045 SMARCA4P51532 1647 aa45.79■■■■■ 4.92
AC139795.1-203ENST00000515045 NCAPD3P42695 1498 aa45.71■■■■■ 4.91
AC139795.1-203ENST00000515045 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.71■■■■■ 4.91
AC139795.1-203ENST00000515045 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.64■■■■■ 4.9
AC139795.1-203ENST00000515045 SMARCA2P51531 1590 aa45.59■■■■■ 4.89
AC139795.1-203ENST00000515045 HMGXB3Q12766 1538 aa45.44■■■■■ 4.86
AC139795.1-203ENST00000515045 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.41■■■■■ 4.86
AC139795.1-203ENST00000515045 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.37■■■■■ 4.85
AC139795.1-203ENST00000515045 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.23■■■■■ 4.83
AC139795.1-203ENST00000515045 WIZO95785 1651 aa44.85■■■■■ 4.77
AC139795.1-203ENST00000515045 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.75■■■■■ 4.75
AC139795.1-203ENST00000515045 NESP48681 1621 aa44.61■■■■■ 4.73
AC139795.1-203ENST00000515045 ERCC6Q03468 1493 aa44.59■■■■■ 4.73
AC139795.1-203ENST00000515045 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.54■■■■■ 4.72
AC139795.1-203ENST00000515045 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
AC139795.1-203ENST00000515045 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.33■■■■■ 4.69
AC139795.1-203ENST00000515045 CUX2O14529 1486 aa44.33■■■■■ 4.69
AC139795.1-203ENST00000515045 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.25■■■■■ 4.67
AC139795.1-203ENST00000515045 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.1■■■■■ 4.65
AC139795.1-203ENST00000515045 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
AC139795.1-203ENST00000515045 CFTRP13569 1480 aa44.01■■■■■ 4.64
AC139795.1-203ENST00000515045 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.85■■■■■ 4.61
AC139795.1-203ENST00000515045 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.8■■■■■ 4.6
AC139795.1-203ENST00000515045 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.8■■■■■ 4.6
AC139795.1-203ENST00000515045 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.78■■■■■ 4.6
AC139795.1-203ENST00000515045 WDR62O43379 1518 aa43.68■■■■■ 4.58
AC139795.1-203ENST00000515045 PRDM2Q13029 1718 aa43.64■■■■■ 4.58
AC139795.1-203ENST00000515045 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.37■■■■■ 4.53
AC139795.1-203ENST00000515045 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
AC139795.1-203ENST00000515045 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
AC139795.1-203ENST00000515045 ABCC8Q09428 1581 aa43.11■■■■■ 4.49
AC139795.1-203ENST00000515045 TOPBP1Q92547 1522 aa43.06■■■■■ 4.48
AC139795.1-203ENST00000515045 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.99■■■■■ 4.47
AC139795.1-203ENST00000515045 IFT140Q96RY7 1462 aa42.9■■■■■ 4.46
AC139795.1-203ENST00000515045 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
AC139795.1-203ENST00000515045 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.67■■■■■ 4.42
AC139795.1-203ENST00000515045 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.41
AC139795.1-203ENST00000515045 CUX1P39880 1505 aa42.59■■■■■ 4.41
AC139795.1-203ENST00000515045 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
AC139795.1-203ENST00000515045 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.5■■■■■ 4.39
AC139795.1-203ENST00000515045 SOGA1O94964 1423 aa42.49■■■■■ 4.39
AC139795.1-203ENST00000515045 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.44■■■■■ 4.38
AC139795.1-203ENST00000515045 OSCARQ8IYS5 282 aa42.41■■■■■ 4.38
AC139795.1-203ENST00000515045 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.4■■■■■ 4.38
AC139795.1-203ENST00000515045 WDR97A6NE52 1622 aa42.34■■■■■ 4.37
AC139795.1-203ENST00000515045 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.35
AC139795.1-203ENST00000515045 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.2■■■■■ 4.35
AC139795.1-203ENST00000515045 TOP2BQ02880 1626 aa42.16■■■■■ 4.34
AC139795.1-203ENST00000515045 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.16■■■■■ 4.34
AC139795.1-203ENST00000515045 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.11■■■■■ 4.33
AC139795.1-203ENST00000515045 SYNJ1O43426 1573 aa42.08■■■■■ 4.33
AC139795.1-203ENST00000515045 GRIN2BQ13224 1484 aa42.05■■■■■ 4.32
AC139795.1-203ENST00000515045 CHD1O14646 1710 aa42.03■■■■■ 4.32
AC139795.1-203ENST00000515045 GAPVD1Q14C86 1478 aa42■■■■■ 4.31
AC139795.1-203ENST00000515045 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42■■■■■ 4.31
AC139795.1-203ENST00000515045 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
AC139795.1-203ENST00000515045 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.96■■■■■ 4.31
AC139795.1-203ENST00000515045 FBLN2P98095 1184 aa41.92■■■■■ 4.3
AC139795.1-203ENST00000515045 PBRM1Q86U86 1689 aa41.9■■■■■ 4.3
AC139795.1-203ENST00000515045 SYNJ2O15056 1496 aa41.83■■■■■ 4.29
AC139795.1-203ENST00000515045 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
AC139795.1-203ENST00000515045 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.73■■■■■ 4.27
AC139795.1-203ENST00000515045 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.73■■■■■ 4.27
AC139795.1-203ENST00000515045 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.73■■■■■ 4.27
AC139795.1-203ENST00000515045 ARHGEF11O15085 1522 aa41.69■■■■■ 4.27
AC139795.1-203ENST00000515045 TRIM41Q8WV44 630 aa41.67■■■■■ 4.26
AC139795.1-203ENST00000515045 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.62■■■■■ 4.25
AC139795.1-203ENST00000515045 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.61■■■■■ 4.25
AC139795.1-203ENST00000515045 ADAMTS12P58397 1594 aa41.57■■■■■ 4.25
AC139795.1-203ENST00000515045 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.52■■■■■ 4.24
AC139795.1-203ENST00000515045 GRIN2AQ12879 1464 aa41.5■■■■■ 4.23
AC139795.1-203ENST00000515045 KIF27Q86VH2 1401 aa41.36■■■■■ 4.21
AC139795.1-203ENST00000515045 NUP160Q12769 1436 aa41.35■■■■■ 4.21
AC139795.1-203ENST00000515045 ARAP1Q96P48 1450 aa41.33■■■■■ 4.21
AC139795.1-203ENST00000515045 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.3■■■■■ 4.2
AC139795.1-203ENST00000515045 CEP170Q5SW79 1584 aa41.29■■■■■ 4.2
AC139795.1-203ENST00000515045 IGF1RP08069 1367 aa41.24■■■■■ 4.19
AC139795.1-203ENST00000515045 CUL7Q14999 1698 aa41.16■■■■■ 4.18
AC139795.1-203ENST00000515045 SHROOM2Q13796 1616 aa41.08■■■■■ 4.17
AC139795.1-203ENST00000515045 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.98■■■■■ 4.15
AC139795.1-203ENST00000515045 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.97■■■■■ 4.15
AC139795.1-203ENST00000515045 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.95■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms