RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263038.8

PHYH-201, Transcript of phytanoyl-CoA 2-hydroxylase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PHYH, Length 1,577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYH-201ENST00000263038 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.48■■■■■ 6.95
PHYH-201ENST00000263038 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.67■■■■■ 5.86
PHYH-201ENST00000263038 ABCC9O60706 1549 aa49.96■■■■■ 5.59
PHYH-201ENST00000263038 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.88■■■■■ 5.42
PHYH-201ENST00000263038 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.66■■■■■ 5.38
PHYH-201ENST00000263038 NACADO15069 1562 aa48.36■■■■■ 5.33
PHYH-201ENST00000263038 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.33■■■■■ 5.33
PHYH-201ENST00000263038 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.28■■■■■ 5.32
PHYH-201ENST00000263038 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.23■■■■■ 5.31
PHYH-201ENST00000263038 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.35■■■■■ 5.17
PHYH-201ENST00000263038 SCRIBQ14160 1630 aa47.33■■■■■ 5.17
PHYH-201ENST00000263038 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.85■■■■■ 5.09
PHYH-201ENST00000263038 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.81■■■■■ 5.08
PHYH-201ENST00000263038 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.8■■■■■ 5.08
PHYH-201ENST00000263038 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.55■■■■■ 4.88
PHYH-201ENST00000263038 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.54■■■■■ 4.88
PHYH-201ENST00000263038 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.27■■■■■ 4.84
PHYH-201ENST00000263038 SMARCA4P51532 1647 aa45.27■■■■■ 4.84
PHYH-201ENST00000263038 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.2■■■■■ 4.83
PHYH-201ENST00000263038 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.17■■■■■ 4.82
PHYH-201ENST00000263038 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.14■■■■■ 4.82
PHYH-201ENST00000263038 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.83■■■■■ 4.77
PHYH-201ENST00000263038 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.79■■■■■ 4.76
PHYH-201ENST00000263038 SMARCA2P51531 1590 aa44.75■■■■■ 4.75
PHYH-201ENST00000263038 WIZO95785 1651 aa44.74■■■■■ 4.75
PHYH-201ENST00000263038 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.73■■■■■ 4.75
PHYH-201ENST00000263038 NCAPD3P42695 1498 aa44.6■■■■■ 4.73
PHYH-201ENST00000263038 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
PHYH-201ENST00000263038 HMGXB3Q12766 1538 aa44.49■■■■■ 4.71
PHYH-201ENST00000263038 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.34■■■■■ 4.69
PHYH-201ENST00000263038 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
PHYH-201ENST00000263038 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.71■■■■■ 4.59
PHYH-201ENST00000263038 NESP48681 1621 aa43.46■■■■■ 4.55
PHYH-201ENST00000263038 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.37■■■■■ 4.53
PHYH-201ENST00000263038 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.36■■■■■ 4.53
PHYH-201ENST00000263038 CFTRP13569 1480 aa43.27■■■■■ 4.52
PHYH-201ENST00000263038 PRDM2Q13029 1718 aa43.11■■■■■ 4.49
PHYH-201ENST00000263038 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.01■■■■■ 4.48
PHYH-201ENST00000263038 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43■■■■■ 4.47
PHYH-201ENST00000263038 ERCC6Q03468 1493 aa42.97■■■■■ 4.47
PHYH-201ENST00000263038 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.92■■■■■ 4.46
PHYH-201ENST00000263038 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.8■■■■■ 4.44
PHYH-201ENST00000263038 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
PHYH-201ENST00000263038 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.57■■■■■ 4.41
PHYH-201ENST00000263038 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
PHYH-201ENST00000263038 ABCC8Q09428 1581 aa42.43■■■■■ 4.38
PHYH-201ENST00000263038 WDR62O43379 1518 aa42.41■■■■■ 4.38
PHYH-201ENST00000263038 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.33■■■■■ 4.37
PHYH-201ENST00000263038 TOPBP1Q92547 1522 aa42.33■■■■■ 4.37
PHYH-201ENST00000263038 CUX1P39880 1505 aa42.3■■■■■ 4.36
PHYH-201ENST00000263038 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.26■■■■■ 4.36
PHYH-201ENST00000263038 SYNJ1O43426 1573 aa42.19■■■■■ 4.34
PHYH-201ENST00000263038 CUX2O14529 1486 aa42.17■■■■■ 4.34
PHYH-201ENST00000263038 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.11■■■■■ 4.33
PHYH-201ENST00000263038 TOP2BQ02880 1626 aa42.11■■■■■ 4.33
PHYH-201ENST00000263038 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.04■■■■■ 4.32
PHYH-201ENST00000263038 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
PHYH-201ENST00000263038 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.87■■■■■ 4.29
PHYH-201ENST00000263038 SOGA1O94964 1423 aa41.83■■■■■ 4.29
PHYH-201ENST00000263038 IFT140Q96RY7 1462 aa41.82■■■■■ 4.29
PHYH-201ENST00000263038 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
PHYH-201ENST00000263038 TRIM41Q8WV44 630 aa41.76■■■■■ 4.28
PHYH-201ENST00000263038 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.73■■■■■ 4.27
PHYH-201ENST00000263038 WDR97A6NE52 1622 aa41.69■■■■■ 4.26
PHYH-201ENST00000263038 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
PHYH-201ENST00000263038 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.61■■■■■ 4.25
PHYH-201ENST00000263038 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
PHYH-201ENST00000263038 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
PHYH-201ENST00000263038 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.51■■■■■ 4.24
PHYH-201ENST00000263038 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.44■■■■■ 4.22
PHYH-201ENST00000263038 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.37■■■■■ 4.21
PHYH-201ENST00000263038 PBRM1Q86U86 1689 aa41.34■■■■■ 4.21
PHYH-201ENST00000263038 KIF27Q86VH2 1401 aa41.29■■■■■ 4.2
PHYH-201ENST00000263038 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.26■■■■■ 4.2
PHYH-201ENST00000263038 GRIN2BQ13224 1484 aa41.24■■■■■ 4.19
PHYH-201ENST00000263038 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.15■■■■■ 4.18
PHYH-201ENST00000263038 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.12■■■■■ 4.17
PHYH-201ENST00000263038 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
PHYH-201ENST00000263038 IGF1RP08069 1367 aa41.02■■■■■ 4.16
PHYH-201ENST00000263038 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
PHYH-201ENST00000263038 ADAMTS12P58397 1594 aa41■■■■■ 4.15
PHYH-201ENST00000263038 CHD1O14646 1710 aa40.93■■■■■ 4.14
PHYH-201ENST00000263038 EEA1Q15075 1411 aa40.93■■■■■ 4.14
PHYH-201ENST00000263038 CUL7Q14999 1698 aa40.93■■■■■ 4.14
PHYH-201ENST00000263038 SYNJ2O15056 1496 aa40.89■■■■■ 4.14
PHYH-201ENST00000263038 FBLN2P98095 1184 aa40.89■■■■■ 4.14
PHYH-201ENST00000263038 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.88■■■■■ 4.13
PHYH-201ENST00000263038 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
PHYH-201ENST00000263038 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.82■■■■■ 4.12
PHYH-201ENST00000263038 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.81■■■■■ 4.12
PHYH-201ENST00000263038 GRIN2AQ12879 1464 aa40.74■■■■■ 4.11
PHYH-201ENST00000263038 PRXQ9BXM0 1461 aa40.68■■■■■ 4.1
PHYH-201ENST00000263038 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.66■■■■■ 4.1
PHYH-201ENST00000263038 CEP170Q5SW79 1584 aa40.56■■■■■ 4.08
PHYH-201ENST00000263038 OSCARQ8IYS5 282 aa40.55■■■■■ 4.08
PHYH-201ENST00000263038 KIF21BO75037 1637 aa40.55■■■■■ 4.08
PHYH-201ENST00000263038 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.5■■■■■ 4.07
PHYH-201ENST00000263038 NUP160Q12769 1436 aa40.49■■■■■ 4.07
PHYH-201ENST00000263038 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.41■■■■■ 4.06
PHYH-201ENST00000263038 GOLGA3Q08378 1498 aa40.36■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.6 ms