RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401724.1

BARX1-202, Transcript of BARX homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BARX1, Length 1,323 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX1-202ENST00000401724 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.61■■■■■ 6.97
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BARX1-202ENST00000401724 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.92■■■■■ 5.42
BARX1-202ENST00000401724 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.81■■■■■ 5.4
BARX1-202ENST00000401724 NACADO15069 1562 aa48.74■■■■■ 5.39
BARX1-202ENST00000401724 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.72■■■■■ 5.39
BARX1-202ENST00000401724 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.54■■■■■ 5.36
BARX1-202ENST00000401724 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.5■■■■■ 5.36
BARX1-202ENST00000401724 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.67■■■■■ 5.22
BARX1-202ENST00000401724 SCRIBQ14160 1630 aa47.47■■■■■ 5.19
BARX1-202ENST00000401724 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.19■■■■■ 5.14
BARX1-202ENST00000401724 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.16■■■■■ 5.14
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BARX1-202ENST00000401724 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
BARX1-202ENST00000401724 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.82■■■■■ 4.93
BARX1-202ENST00000401724 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.66■■■■■ 4.9
BARX1-202ENST00000401724 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.6■■■■■ 4.89
BARX1-202ENST00000401724 SMARCA4P51532 1647 aa45.43■■■■■ 4.86
BARX1-202ENST00000401724 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.42■■■■■ 4.86
BARX1-202ENST00000401724 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.18■■■■■ 4.82
BARX1-202ENST00000401724 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.03■■■■■ 4.8
BARX1-202ENST00000401724 SMARCA2P51531 1590 aa45.03■■■■■ 4.8
BARX1-202ENST00000401724 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.94■■■■■ 4.78
BARX1-202ENST00000401724 NCAPD3P42695 1498 aa44.92■■■■■ 4.78
BARX1-202ENST00000401724 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.79■■■■■ 4.76
BARX1-202ENST00000401724 HMGXB3Q12766 1538 aa44.79■■■■■ 4.76
BARX1-202ENST00000401724 WIZO95785 1651 aa44.76■■■■■ 4.76
BARX1-202ENST00000401724 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.72■■■■■ 4.75
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BARX1-202ENST00000401724 NESP48681 1621 aa43.75■■■■■ 4.59
BARX1-202ENST00000401724 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.74■■■■■ 4.59
BARX1-202ENST00000401724 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.73■■■■■ 4.59
BARX1-202ENST00000401724 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.64■■■■■ 4.58
BARX1-202ENST00000401724 CFTRP13569 1480 aa43.48■■■■■ 4.55
BARX1-202ENST00000401724 ERCC6Q03468 1493 aa43.46■■■■■ 4.55
BARX1-202ENST00000401724 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.39■■■■■ 4.54
BARX1-202ENST00000401724 PRDM2Q13029 1718 aa43.32■■■■■ 4.53
BARX1-202ENST00000401724 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.32■■■■■ 4.53
BARX1-202ENST00000401724 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.18■■■■■ 4.5
BARX1-202ENST00000401724 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.11■■■■■ 4.49
BARX1-202ENST00000401724 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.04■■■■■ 4.48
BARX1-202ENST00000401724 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.95■■■■■ 4.47
BARX1-202ENST00000401724 CUX2O14529 1486 aa42.82■■■■■ 4.45
BARX1-202ENST00000401724 WDR62O43379 1518 aa42.78■■■■■ 4.44
BARX1-202ENST00000401724 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.72■■■■■ 4.43
BARX1-202ENST00000401724 ABCC8Q09428 1581 aa42.56■■■■■ 4.4
BARX1-202ENST00000401724 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.55■■■■■ 4.4
BARX1-202ENST00000401724 TOPBP1Q92547 1522 aa42.54■■■■■ 4.4
BARX1-202ENST00000401724 CUX1P39880 1505 aa42.37■■■■■ 4.37
BARX1-202ENST00000401724 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.25■■■■■ 4.35
BARX1-202ENST00000401724 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
BARX1-202ENST00000401724 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.17■■■■■ 4.34
BARX1-202ENST00000401724 IFT140Q96RY7 1462 aa42.16■■■■■ 4.34
BARX1-202ENST00000401724 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.15■■■■■ 4.34
BARX1-202ENST00000401724 SYNJ1O43426 1573 aa42.14■■■■■ 4.34
BARX1-202ENST00000401724 TOP2BQ02880 1626 aa42.13■■■■■ 4.33
BARX1-202ENST00000401724 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
BARX1-202ENST00000401724 SOGA1O94964 1423 aa42.02■■■■■ 4.32
BARX1-202ENST00000401724 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.01■■■■■ 4.31
BARX1-202ENST00000401724 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
BARX1-202ENST00000401724 WDR97A6NE52 1622 aa41.84■■■■■ 4.29
BARX1-202ENST00000401724 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
BARX1-202ENST00000401724 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.77■■■■■ 4.28
BARX1-202ENST00000401724 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.73■■■■■ 4.27
BARX1-202ENST00000401724 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
BARX1-202ENST00000401724 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.6■■■■■ 4.25
BARX1-202ENST00000401724 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.56■■■■■ 4.24
BARX1-202ENST00000401724 PBRM1Q86U86 1689 aa41.53■■■■■ 4.24
BARX1-202ENST00000401724 TRIM41Q8WV44 630 aa41.52■■■■■ 4.24
BARX1-202ENST00000401724 GRIN2BQ13224 1484 aa41.5■■■■■ 4.23
BARX1-202ENST00000401724 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.41■■■■■ 4.22
BARX1-202ENST00000401724 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
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BARX1-202ENST00000401724 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.3■■■■■ 4.2
BARX1-202ENST00000401724 CHD1O14646 1710 aa41.27■■■■■ 4.2
BARX1-202ENST00000401724 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.26■■■■■ 4.2
BARX1-202ENST00000401724 ADAMTS12P58397 1594 aa41.18■■■■■ 4.18
BARX1-202ENST00000401724 FBLN2P98095 1184 aa41.18■■■■■ 4.18
BARX1-202ENST00000401724 SYNJ2O15056 1496 aa41.17■■■■■ 4.18
BARX1-202ENST00000401724 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
BARX1-202ENST00000401724 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.09■■■■■ 4.17
BARX1-202ENST00000401724 OSCARQ8IYS5 282 aa41.09■■■■■ 4.17
BARX1-202ENST00000401724 IGF1RP08069 1367 aa41.07■■■■■ 4.17
BARX1-202ENST00000401724 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.07■■■■■ 4.17
BARX1-202ENST00000401724 CUL7Q14999 1698 aa41.04■■■■■ 4.16
BARX1-202ENST00000401724 GRIN2AQ12879 1464 aa40.97■■■■■ 4.15
BARX1-202ENST00000401724 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.96■■■■■ 4.15
BARX1-202ENST00000401724 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.87■■■■■ 4.13
BARX1-202ENST00000401724 EEA1Q15075 1411 aa40.83■■■■■ 4.13
BARX1-202ENST00000401724 CEP170Q5SW79 1584 aa40.76■■■■■ 4.12
BARX1-202ENST00000401724 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.76■■■■■ 4.12
BARX1-202ENST00000401724 NUP160Q12769 1436 aa40.75■■■■■ 4.11
BARX1-202ENST00000401724 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.69■■■■■ 4.1
BARX1-202ENST00000401724 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.68■■■■■ 4.1
BARX1-202ENST00000401724 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
BARX1-202ENST00000401724 PRXQ9BXM0 1461 aa40.62■■■■■ 4.09
BARX1-202ENST00000401724 ARHGEF11O15085 1522 aa40.47■■■■■ 4.07
BARX1-202ENST00000401724 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.46■■■■■ 4.07
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