RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514050.6

RASGEF1B-211, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

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Gene RASGEF1B, Length 537 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-211ENST00000514050 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.42■■■■■ 6.94
RASGEF1B-211ENST00000514050 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.83■■■■■ 5.89
RASGEF1B-211ENST00000514050 ABCC9O60706 1549 aa50.72■■■■■ 5.71
RASGEF1B-211ENST00000514050 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.86■■■■■ 5.41
RASGEF1B-211ENST00000514050 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.81■■■■■ 5.4
RASGEF1B-211ENST00000514050 NACADO15069 1562 aa48.79■■■■■ 5.4
RASGEF1B-211ENST00000514050 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.67■■■■■ 5.38
RASGEF1B-211ENST00000514050 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.55■■■■■ 5.36
RASGEF1B-211ENST00000514050 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.36■■■■■ 5.33
RASGEF1B-211ENST00000514050 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.54■■■■■ 5.2
RASGEF1B-211ENST00000514050 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.46■■■■■ 5.19
RASGEF1B-211ENST00000514050 SCRIBQ14160 1630 aa47.32■■■■■ 5.17
RASGEF1B-211ENST00000514050 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.29■■■■■ 5.16
RASGEF1B-211ENST00000514050 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.89■■■■■ 5.1
RASGEF1B-211ENST00000514050 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.67■■■■■ 5.06
RASGEF1B-211ENST00000514050 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.07■■■■■ 4.97
RASGEF1B-211ENST00000514050 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.85■■■■■ 4.93
RASGEF1B-211ENST00000514050 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.58■■■■■ 4.89
RASGEF1B-211ENST00000514050 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.28■■■■■ 4.84
RASGEF1B-211ENST00000514050 SMARCA4P51532 1647 aa45.27■■■■■ 4.84
RASGEF1B-211ENST00000514050 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.07■■■■■ 4.81
RASGEF1B-211ENST00000514050 NCAPD3P42695 1498 aa45.06■■■■■ 4.8
RASGEF1B-211ENST00000514050 SMARCA2P51531 1590 aa45.01■■■■■ 4.8
RASGEF1B-211ENST00000514050 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.01■■■■■ 4.8
RASGEF1B-211ENST00000514050 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.86■■■■■ 4.77
RASGEF1B-211ENST00000514050 HMGXB3Q12766 1538 aa44.79■■■■■ 4.76
RASGEF1B-211ENST00000514050 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.7■■■■■ 4.75
RASGEF1B-211ENST00000514050 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.57■■■■■ 4.72
RASGEF1B-211ENST00000514050 WIZO95785 1651 aa44.48■■■■■ 4.71
RASGEF1B-211ENST00000514050 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
RASGEF1B-211ENST00000514050 NESP48681 1621 aa43.89■■■■■ 4.62
RASGEF1B-211ENST00000514050 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.8■■■■■ 4.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.77■■■■■ 4.6
RASGEF1B-211ENST00000514050 ERCC6Q03468 1493 aa43.74■■■■■ 4.59
RASGEF1B-211ENST00000514050 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.58■■■■■ 4.57
RASGEF1B-211ENST00000514050 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.57■■■■■ 4.57
RASGEF1B-211ENST00000514050 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
RASGEF1B-211ENST00000514050 CFTRP13569 1480 aa43.5■■■■■ 4.55
RASGEF1B-211ENST00000514050 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.28■■■■■ 4.52
RASGEF1B-211ENST00000514050 CUX2O14529 1486 aa43.25■■■■■ 4.51
RASGEF1B-211ENST00000514050 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.22■■■■■ 4.51
RASGEF1B-211ENST00000514050 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
RASGEF1B-211ENST00000514050 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.16■■■■■ 4.5
RASGEF1B-211ENST00000514050 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.08■■■■■ 4.49
RASGEF1B-211ENST00000514050 PRDM2Q13029 1718 aa42.99■■■■■ 4.47
RASGEF1B-211ENST00000514050 WDR62O43379 1518 aa42.92■■■■■ 4.46
RASGEF1B-211ENST00000514050 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
RASGEF1B-211ENST00000514050 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.76■■■■■ 4.44
RASGEF1B-211ENST00000514050 ABCC8Q09428 1581 aa42.57■■■■■ 4.41
RASGEF1B-211ENST00000514050 TOPBP1Q92547 1522 aa42.52■■■■■ 4.4
RASGEF1B-211ENST00000514050 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.47■■■■■ 4.39
RASGEF1B-211ENST00000514050 IFT140Q96RY7 1462 aa42.27■■■■■ 4.36
RASGEF1B-211ENST00000514050 CUX1P39880 1505 aa42.22■■■■■ 4.35
RASGEF1B-211ENST00000514050 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
RASGEF1B-211ENST00000514050 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.08■■■■■ 4.33
RASGEF1B-211ENST00000514050 SOGA1O94964 1423 aa42.05■■■■■ 4.32
RASGEF1B-211ENST00000514050 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
RASGEF1B-211ENST00000514050 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.03■■■■■ 4.32
RASGEF1B-211ENST00000514050 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
RASGEF1B-211ENST00000514050 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.99■■■■■ 4.31
RASGEF1B-211ENST00000514050 TOP2BQ02880 1626 aa41.87■■■■■ 4.29
RASGEF1B-211ENST00000514050 SYNJ1O43426 1573 aa41.84■■■■■ 4.29
RASGEF1B-211ENST00000514050 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.84■■■■■ 4.29
RASGEF1B-211ENST00000514050 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
RASGEF1B-211ENST00000514050 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.83■■■■■ 4.29
RASGEF1B-211ENST00000514050 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
RASGEF1B-211ENST00000514050 WDR97A6NE52 1622 aa41.72■■■■■ 4.27
RASGEF1B-211ENST00000514050 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.69■■■■■ 4.27
RASGEF1B-211ENST00000514050 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.54■■■■■ 4.24
RASGEF1B-211ENST00000514050 OSCARQ8IYS5 282 aa41.54■■■■■ 4.24
RASGEF1B-211ENST00000514050 GRIN2BQ13224 1484 aa41.53■■■■■ 4.24
RASGEF1B-211ENST00000514050 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.45■■■■■ 4.23
RASGEF1B-211ENST00000514050 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.44■■■■■ 4.22
RASGEF1B-211ENST00000514050 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
RASGEF1B-211ENST00000514050 FBLN2P98095 1184 aa41.37■■■■■ 4.21
RASGEF1B-211ENST00000514050 PBRM1Q86U86 1689 aa41.32■■■■■ 4.2
RASGEF1B-211ENST00000514050 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
RASGEF1B-211ENST00000514050 SYNJ2O15056 1496 aa41.25■■■■■ 4.19
RASGEF1B-211ENST00000514050 CHD1O14646 1710 aa41.23■■■■■ 4.19
RASGEF1B-211ENST00000514050 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.19■■■■■ 4.18
RASGEF1B-211ENST00000514050 KIF27Q86VH2 1401 aa41.16■■■■■ 4.18
RASGEF1B-211ENST00000514050 TRIM41Q8WV44 630 aa41.14■■■■■ 4.18
RASGEF1B-211ENST00000514050 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.09■■■■■ 4.17
RASGEF1B-211ENST00000514050 ADAMTS12P58397 1594 aa41.06■■■■■ 4.16
RASGEF1B-211ENST00000514050 IGF1RP08069 1367 aa40.99■■■■■ 4.15
RASGEF1B-211ENST00000514050 GRIN2AQ12879 1464 aa40.97■■■■■ 4.15
RASGEF1B-211ENST00000514050 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.88■■■■■ 4.13
RASGEF1B-211ENST00000514050 NUP160Q12769 1436 aa40.81■■■■■ 4.12
RASGEF1B-211ENST00000514050 CUL7Q14999 1698 aa40.78■■■■■ 4.12
RASGEF1B-211ENST00000514050 ARHGEF11O15085 1522 aa40.77■■■■■ 4.12
RASGEF1B-211ENST00000514050 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.75■■■■■ 4.11
RASGEF1B-211ENST00000514050 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.75■■■■■ 4.11
RASGEF1B-211ENST00000514050 CEP170Q5SW79 1584 aa40.73■■■■■ 4.11
RASGEF1B-211ENST00000514050 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.72■■■■■ 4.11
RASGEF1B-211ENST00000514050 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.72■■■■■ 4.11
RASGEF1B-211ENST00000514050 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.72■■■■■ 4.11
RASGEF1B-211ENST00000514050 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.67■■■■■ 4.1
RASGEF1B-211ENST00000514050 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.5■■■■■ 4.07
RASGEF1B-211ENST00000514050 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.46■■■■■ 4.07
RASGEF1B-211ENST00000514050 ARAP1Q96P48 1450 aa40.45■■■■■ 4.07
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