Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNOT8Q9UFF9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNOT8Q9UFF9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNOT8Q9UFF9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNOT8Q9UFF9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNOT8Q9UFF9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNOT8Q9UFF9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNOT8Q9UFF9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNOT8Q9UFF9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNOT8Q9UFF9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNOT8Q9UFF9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNOT8Q9UFF9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNOT8Q9UFF9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNOT8Q9UFF9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNOT8Q9UFF9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNOT8Q9UFF9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNOT8Q9UFF9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNOT8Q9UFF9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms