Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 NSFL1C-211ENST00000555359 450 ntTSL 322.63■■□□□ 1.214e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 GNAI2-205ENST00000441156 2168 ntTSL 222.53■■□□□ 1.24e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NSFL1C-205ENST00000470376 845 ntTSL 322.42■■□□□ 1.184e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.174e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.17e-11■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NSFL1C-203ENST00000381653 1446 ntTSL 521.79■■□□□ 1.084e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.034e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.917e-11■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.97e-11■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.894e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 GNAI2-212ENST00000492383 989 ntTSL 220.42■□□□□ 0.864e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.864e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 GNB2-212ENST00000470354 902 ntTSL 520.39■□□□□ 0.857e-11■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 USF2-216ENST00000607959 1920 ntTSL 520.33■□□□□ 0.854e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.844e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ZNF706-210ENST00000520454 488 ntTSL 320.26■□□□□ 0.834e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 CDK11A-211ENST00000464748 381 ntTSL 320.06■□□□□ 0.88e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.84e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.794e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PKD1-218ENST00000485120 696 ntTSL 319.82■□□□□ 0.764e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.764e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.757e-11■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.744e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SNRNP70-205ENST00000597936 580 ntTSL 219.65■□□□□ 0.744e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NSFL1C-212ENST00000555568 863 ntTSL 319.54■□□□□ 0.724e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PKD1-223ENST00000561668 665 ntTSL 319.27■□□□□ 0.684e-6■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 SNRNP70-207ENST00000598984 547 ntTSL 518.82■□□□□ 0.64e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.557e-11■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 U2AF2-208ENST00000592874 849 ntTSL 518.48■□□□□ 0.554e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 BOLA3-203ENST00000469676 1436 ntTSL 518.44■□□□□ 0.544e-6■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 CDK11A-220ENST00000492390 976 ntTSL 317.94■□□□□ 0.462e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.464e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 UNC13D-203ENST00000585574 658 ntTSL 317.9■□□□□ 0.464e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.452e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HIST2H2BF-203ENST00000469483 752 ntTSL 1 (best)17.82■□□□□ 0.444e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 LIG1-205ENST00000593425 575 ntTSL 417.82■□□□□ 0.447e-11■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 BOLA3-205ENST00000484655 2982 ntTSL 1 (best)17.73■□□□□ 0.434e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 CDK11A-223ENST00000509982 2306 ntTSL 517.7■□□□□ 0.422e-6■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 CDK11A-218ENST00000489300 577 ntTSL 317.4■□□□□ 0.388e-7■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 NSFL1C-213ENST00000555944 2588 ntTSL 216.97■□□□□ 0.314e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.32e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.32e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.32e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.32e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 USF2-208ENST00000596380 550 ntTSL 316.77■□□□□ 0.284e-6■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 DNMT1-229ENST00000593049 534 ntTSL 416.72■□□□□ 0.274e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 CDK11A-202ENST00000356937 2275 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.262e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.264e-6■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.244e-6■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.194e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 CDK11A-209ENST00000460465 2333 ntTSL 1 (best)16.21■□□□□ 0.192e-6■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.184e-6■□□□□ 8.5
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PUM1Q14671 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.062e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 U2AF2-203ENST00000587196 778 ntTSL 315.37■□□□□ 0.054e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 LIG1-219ENST00000600055 602 ntTSL 215.32■□□□□ 0.047e-11■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PKD1-220ENST00000487932 6464 ntTSL 515.26■□□□□ 0.034e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DDB1-218ENST00000540784 1119 ntTSL 315.25■□□□□ 0.034e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.034e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.024e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.024e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 UNC13D-205ENST00000586147 589 ntTSL 515.04■□□□□ -04e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.014e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 BOLA3-204ENST00000477685 667 ntTSL 1 (best)14.99□□□□□ -0.014e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PPP6R1-204ENST00000587457 2389 ntTSL 214.96□□□□□ -0.014e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DDB1-216ENST00000539739 1624 ntTSL 514.81□□□□□ -0.044e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.074e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 UNC13D-210ENST00000587504 1050 ntTSL 514.61□□□□□ -0.074e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 GNAI2-206ENST00000446079 2086 ntTSL 1 (best)14.59□□□□□ -0.074e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.084e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.14e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 CDK11A-219ENST00000491311 626 ntTSL 514.4□□□□□ -0.18e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.114e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 NDE1-211ENST00000576502 1131 ntTSL 214.36□□□□□ -0.114e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ARID3A-202ENST00000457152 549 ntTSL 514.27□□□□□ -0.134e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 GNB2-211ENST00000469287 1702 ntTSL 214.15□□□□□ -0.147e-11■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.157e-11■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 SPRED2-205ENST00000440972 555 ntTSL 314.09□□□□□ -0.157e-11■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 PRKCSH-208ENST00000589126 625 ntTSL 514□□□□□ -0.178e-7■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.91□□□□□ -0.184e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ACTN4-205ENST00000477174 544 ntTSL 313.7□□□□□ -0.224e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 ZC3H4-204ENST00000597069 664 ntTSL 413.64□□□□□ -0.234e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TRA2B-206ENST00000456380 1697 ntTSL 513.61□□□□□ -0.234e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.244e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 TRA2B-208ENST00000465245 634 ntTSL 313.54□□□□□ -0.244e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.264e-6■□□□□ 8.5
PUM1Q14671 GNAI2-210ENST00000490122 2445 ntTSL 213.43□□□□□ -0.264e-6■□□□□ 8.5
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