RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555359.1

NSFL1C-211, Transcript of NSFL1 cofactor, humanhuman

TSL 3

Gene NSFL1C, Length 450 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NSFL1C-211ENST00000555359 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.38■■■■■ 4.37
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NSFL1C-211ENST00000555359 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.33■■■■■ 4.05
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NSFL1C-211ENST00000555359 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.76■■■■□ 3.96
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NSFL1C-211ENST00000555359 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.31■■■■□ 3.88
NSFL1C-211ENST00000555359 WDR62O43379 1518 aa39.3■■■■□ 3.88
NSFL1C-211ENST00000555359 CFTRP13569 1480 aa39.3■■■■□ 3.88
NSFL1C-211ENST00000555359 CCDC88BA6NC98 1476 aa39■■■■□ 3.83
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NSFL1C-211ENST00000555359 OSCARQ8IYS5 282 aa38.7■■■■□ 3.79
NSFL1C-211ENST00000555359 TOPBP1Q92547 1522 aa38.56■■■■□ 3.76
NSFL1C-211ENST00000555359 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.54■■■■□ 3.76
NSFL1C-211ENST00000555359 IFT140Q96RY7 1462 aa38.54■■■■□ 3.76
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NSFL1C-211ENST00000555359 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.05■■■■□ 3.68
NSFL1C-211ENST00000555359 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.05■■■■□ 3.68
NSFL1C-211ENST00000555359 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
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NSFL1C-211ENST00000555359 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.38■■■■□ 3.57
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NSFL1C-211ENST00000555359 CEP170Q5SW79 1584 aa37.03■■■■□ 3.52
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NSFL1C-211ENST00000555359 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.99■■■■□ 3.51
NSFL1C-211ENST00000555359 JPH4Q96JJ6 628 aa36.81■■■■□ 3.48
NSFL1C-211ENST00000555359 SHROOM2Q13796 1616 aa36.79■■■■□ 3.48
NSFL1C-211ENST00000555359 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
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NSFL1C-211ENST00000555359 KIF27Q86VH2 1401 aa36.63■■■■□ 3.45
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