Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 RPL14-204ENST00000435633 966 ntTSL 222.7■■□□□ 1.221e-323■□□□□ 9
PUM1Q14671 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.191e-323■□□□□ 10.2
PUM1Q14671 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.091e-323■□□□□ 9
PUM1Q14671 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.131e-323■□□□□ 9
PUM1Q14671 RPL14-208ENST00000479563 794 ntTSL 1 (best)13□□□□□ -0.331e-323■□□□□ 9
PUM1Q14671 NAP1L1-217ENST00000549988 544 ntTSL 312.74□□□□□ -0.371e-323■□□□□ 10.8
PUM1Q14671 RPS11-206ENST00000600027 944 ntTSL 511.53□□□□□ -0.561e-323■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 RPS11-204ENST00000599167 1133 ntTSL 511.08□□□□□ -0.641e-323■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 RPS11-207ENST00000601216 602 ntTSL 410.82□□□□□ -0.681e-323■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 NAP1L1-207ENST00000547479 623 ntTSL 510.35□□□□□ -0.751e-323■■□□□ 12.2
PUM1Q14671 RPS11-201ENST00000270625 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.811e-323■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 RPS11-209ENST00000602252 751 ntTSL 28.87□□□□□ -0.991e-323■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 RPS11-208ENST00000601306 547 ntTSL 38.24□□□□□ -1.091e-323■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.141e-323■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 NAP1L1-220ENST00000551524 460 ntTSL 27.72□□□□□ -1.171e-323■□□□□ 11.2
PUM1Q14671 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.21e-323■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.271e-323■□□□□ 9
PUM1Q14671 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.271e-323■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 RPL14-209ENST00000481798 604 ntTSL 36.11□□□□□ -1.431e-323■□□□□ 8.6
PUM1Q14671 RPS24-210ENST00000478655 727 ntTSL 1 (best)5.72□□□□□ -1.491e-323■□□□□ 10.2
PUM1Q14671 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.56□□□□□ -1.521e-323■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 RPS24-205ENST00000464716 452 ntTSL 24.85□□□□□ -1.631e-323■□□□□ 10.2
PUM1Q14671 SET-202ENST00000372686 1029 ntTSL 25.29□□□□□ -1.565e-77■□□□□ 10.2
PUM1Q14671 NCL-209ENST00000484328 369 ntTSL 26.16□□□□□ -1.422e-74■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 NAP1L1-222ENST00000551992 1074 ntTSL 524.91■■□□□ 1.581e-69■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 NAP1L1-214ENST00000548273 818 ntTSL 314.04□□□□□ -0.161e-69■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 NAP1L1-221ENST00000551600 786 ntTSL 511.29□□□□□ -0.61e-69■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 NAP1L1-209ENST00000547704 760 ntTSL 511.29□□□□□ -0.61e-69■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 NAP1L1-218ENST00000550934 851 ntTSL 56.3□□□□□ -1.41e-69■■■□□ 15.1
PUM1Q14671 RPS8-207ENST00000485390 1115 ntTSL 1 (best)23.06■■□□□ 1.286e-67■□□□□ 10.8
PUM1Q14671 RPS8-206ENST00000484599 852 ntTSL 312.54□□□□□ -0.46e-67■□□□□ 10.8
PUM1Q14671 RPS8-202ENST00000396651 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.426e-67■□□□□ 10.8
PUM1Q14671 RPS8-201ENST00000372209 685 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.666e-67■□□□□ 10.8
PUM1Q14671 RPS8-203ENST00000464658 898 ntTSL 29.92□□□□□ -0.826e-67■□□□□ 10.8
PUM1Q14671 RPS8-205ENST00000474582 391 ntTSL 1 (best)12.4□□□□□ -0.426e-67■□□□□ 10.9
PUM1Q14671 STMN1-205ENST00000446334 665 ntTSL 26.36□□□□□ -1.399e-67■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 RPS8-208ENST00000497035 694 ntTSL 314.16□□□□□ -0.141e-66■□□□□ 9.6
PUM1Q14671 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.532e-66■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 HSP90B1-202ENST00000540297 590 ntTSL 320.15■□□□□ 0.824e-66■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 HSP90B1-205ENST00000549334 581 ntTSL 418.17■□□□□ 0.54e-66■■□□□ 12.6
PUM1Q14671 HSP90B1-204ENST00000548622 839 ntTSL 218.99■□□□□ 0.634e-66■□□□□ 10.5
PUM1Q14671 RPLP2-203ENST00000525722 489 ntTSL 211.8□□□□□ -0.521e-60■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 RPLP2-204ENST00000526222 350 ntTSL 211.8□□□□□ -0.521e-60■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 RPLP2-205ENST00000527517 646 ntTSL 210.72□□□□□ -0.691e-60■□□□□ 10.2
PUM1Q14671 RPL4-209ENST00000565723 408 ntTSL 310.54□□□□□ -0.728e-58■■□□□ 14
PUM1Q14671 RPL35-203ENST00000487431 785 ntTSL 1 (best)23.09■■□□□ 1.292e-56■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.092e-56■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RPL35-204ENST00000493018 692 ntTSL 312.57□□□□□ -0.42e-56■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RPL35-202ENST00000373570 493 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.782e-56■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.299e-56■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.159e-56■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPLP2-208ENST00000532004 353 ntTSL 315.6■□□□□ 0.099e-56■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPLP2-206ENST00000530398 313 ntTSL 311.88□□□□□ -0.519e-56■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPLP2-202ENST00000524867 598 ntTSL 226.21■■□□□ 1.795e-55■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 RPS18-236ENST00000490191 996 ntTSL 218.02■□□□□ 0.483e-54■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS18-234ENST00000476222 685 ntTSL 1 (best)12.38□□□□□ -0.433e-54■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS18-230ENST00000439602 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.433e-54■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS18-235ENST00000479802 413 ntTSL 212.38□□□□□ -0.433e-54■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS18-233ENST00000474973 589 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.433e-54■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS18-231ENST00000472218 1109 ntTSL 210□□□□□ -0.813e-54■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS18-232ENST00000474626 639 ntTSL 39.94□□□□□ -0.823e-54■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS18-237ENST00000496813 642 ntTSL 29.51□□□□□ -0.893e-54■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPL4-207ENST00000564647 1110 ntTSL 27.1□□□□□ -1.272e-53■□□□□ 9.5
PUM1Q14671 FTL-201ENST00000331825 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.564e-52■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 RPL19-202ENST00000577741 1303 ntTSL 29.99□□□□□ -0.812e-51■■□□□ 12.8
PUM1Q14671 RPL19-203ENST00000577759 564 nt10.71□□□□□ -0.692e-51■■□□□ 13.2
PUM1Q14671 PRPF40A-211ENST00000493468 1043 ntTSL 1 (best)16.17■□□□□ 0.186e-50■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 PRPF40A-201ENST00000354363 1622 ntTSL 215.59■□□□□ 0.096e-50■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 PRPF40A-212ENST00000545856 1358 ntTSL 1 (best)15.14■□□□□ 0.016e-50■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 NCL-205ENST00000453992 964 ntTSL 419.04■□□□□ 0.647e-49■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NCL-206ENST00000454824 606 ntTSL 36.92□□□□□ -1.37e-49■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NCL-203ENST00000417652 568 ntTSL 46.92□□□□□ -1.37e-49■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NCL-204ENST00000436894 562 ntTSL 45.02□□□□□ -1.617e-49■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 NPM1-206ENST00000519955 571 ntTSL 26.53□□□□□ -1.364e-46■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.564e-46■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RPS25-201ENST00000524864 1078 ntTSL 214.16□□□□□ -0.144e-46■□□□□ 10.7
PUM1Q14671 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.314e-45■■■□□ 15.2
PUM1Q14671 PTMA-211ENST00000468027 621 ntTSL 1 (best)13.23□□□□□ -0.294e-45■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 SRRM2-228ENST00000576878 1141 ntTSL 217.3■□□□□ 0.361e-44■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 SRRM2-220ENST00000574593 1440 ntTSL 316.41■□□□□ 0.221e-44■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 SRRM2-206ENST00000571041 498 ntTSL 416.18■□□□□ 0.181e-44■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 SRRM2-204ENST00000570705 675 ntTSL 315.42■□□□□ 0.061e-44■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 SRRM2-213ENST00000573311 732 ntTSL 215.39■□□□□ 0.051e-44■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 SRRM2-211ENST00000572883 887 ntTSL 210.38□□□□□ -0.751e-44■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 FTH1-206ENST00000530019 550 ntTSL 416■□□□□ 0.154e-44■□□□□ 10.2
PUM1Q14671 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.154e-44■□□□□ 10.2
PUM1Q14671 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.154e-44■□□□□ 10.2
PUM1Q14671 FTH1-211ENST00000534719 788 ntTSL 1 (best)14.38□□□□□ -0.114e-44■□□□□ 10.2
PUM1Q14671 FTH1-210ENST00000534180 983 ntTSL 213.95□□□□□ -0.184e-44■□□□□ 10.2
PUM1Q14671 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.34e-44■□□□□ 10.2
PUM1Q14671 FTH1-208ENST00000532829 912 ntTSL 212.23□□□□□ -0.454e-44■□□□□ 10.2
PUM1Q14671 FTH1-209ENST00000533138 885 ntTSL 511.89□□□□□ -0.514e-44■□□□□ 10.2
PUM1Q14671 FTH1-203ENST00000529191 530 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.554e-44■□□□□ 10.2
PUM1Q14671 FTH1-204ENST00000529548 567 ntTSL 310.46□□□□□ -0.734e-44■□□□□ 10.2
PUM1Q14671 FTH1-212ENST00000620041 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.864e-44■□□□□ 10.2
PUM1Q14671 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.195e-44■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 RPS24-209ENST00000476545 815 ntTSL 313.78□□□□□ -0.25e-44■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 RPS24-206ENST00000465692 778 ntTSL 211.8□□□□□ -0.525e-44■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 RPS24-212ENST00000482069 539 ntTSL 311.73□□□□□ -0.535e-44■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.565e-44■■□□□ 11.7
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 158.7 ms