Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 OGT-204ENST00000455587 632 ntTSL 310.11□□□□□ -0.795e-33■■■■■ 191.6
PUM1Q14671 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.265e-33■■■■■ 191.6
PUM1Q14671 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.415e-33■■■■■ 191.6
PUM1Q14671 OGT-210ENST00000488174 7243 ntTSL 55.92□□□□□ -1.465e-33■■■■■ 191.6
PUM1Q14671 PTDSS2-213ENST00000532614 437 ntTSL 313.63□□□□□ -0.235e-8■■■■■ 57
PUM1Q14671 EEF1B2-207ENST00000445505 515 ntTSL 517.2■□□□□ 0.345e-13■■■■■ 56.6
PUM1Q14671 FTSJ3-201ENST00000427159 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.956e-14■■■■■ 56.5
PUM1Q14671 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.796e-8■■■■■ 56
PUM1Q14671 PTDSS2-212ENST00000531520 890 ntTSL 319.44■□□□□ 0.76e-8■■■■■ 56
PUM1Q14671 PTDSS2-205ENST00000526878 3134 ntTSL 211.15□□□□□ -0.636e-8■■■■■ 56
PUM1Q14671 FADS3-212ENST00000534223 800 ntTSL 514.86□□□□□ -0.033e-9■■■■■ 55.7
PUM1Q14671 EEF1B2-204ENST00000415904 649 ntTSL 312.93□□□□□ -0.341e-12■■■■■ 52.4
PUM1Q14671 EEF1B2-206ENST00000435123 389 ntTSL 58.49□□□□□ -1.051e-12■■■■■ 52.4
PUM1Q14671 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.539e-13■■■■■ 51.7
PUM1Q14671 SAP30-202ENST00000504618 410 ntTSL 316.82■□□□□ 0.286e-12■■■■■ 48.5
PUM1Q14671 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.381e-17■■■■■ 48.1
PUM1Q14671 FAM193B-219ENST00000524677 1916 ntTSL 216.81■□□□□ 0.282e-11■■■■■ 47.3
PUM1Q14671 FAM193B-204ENST00000505569 1870 ntTSL 1 (best)16.64■□□□□ 0.252e-11■■■■■ 47.3
PUM1Q14671 FAM193B-212ENST00000510163 2237 ntTSL 1 (best)14.72□□□□□ -0.052e-11■■■■■ 47.3
PUM1Q14671 FAM193B-214ENST00000510479 2800 ntTSL 211.28□□□□□ -0.62e-11■■■■■ 47.3
PUM1Q14671 CPNE7-203ENST00000525982 576 ntTSL 522.73■■□□□ 1.234e-11■■■■■ 45.2
PUM1Q14671 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.824e-11■■■■■ 45.2
PUM1Q14671 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.281e-10■■■■■ 44
PUM1Q14671 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.561e-10■■■■■ 44
PUM1Q14671 AC136632.1-201ENST00000477964 591 ntBASIC11.64□□□□□ -0.551e-10■■■■■ 43.8
PUM1Q14671 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.116e-12■■■■■ 42.9
PUM1Q14671 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.243e-10■■■■■ 42.3
PUM1Q14671 YEATS4-201ENST00000247843 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.673e-10■■■■■ 42.3
PUM1Q14671 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC7.29□□□□□ -1.241e-9■■■■■ 41.3
PUM1Q14671 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.813e-7■■■■■ 40.6
PUM1Q14671 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.27e-10■■■■■ 40.5
PUM1Q14671 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.027e-10■■■■■ 40.5
PUM1Q14671 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.067e-10■■■■■ 40.5
PUM1Q14671 EEF1B2-205ENST00000429769 912 ntTSL 513.44□□□□□ -0.267e-10■■■■■ 40.5
PUM1Q14671 EEF1B2-208ENST00000455150 670 ntTSL 57.24□□□□□ -1.257e-10■■■■■ 40.5
PUM1Q14671 TBX1-205ENST00000484336 529 ntTSL 328.04■■■□□ 2.086e-10■■■■■ 40.4
PUM1Q14671 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.526e-10■■■■■ 40.4
PUM1Q14671 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.796e-10■■■■■ 40.4
PUM1Q14671 RUFY1-209ENST00000503583 854 ntTSL 214.76□□□□□ -0.056e-10■■■■■ 40.4
PUM1Q14671 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.196e-10■■■■■ 40.4
PUM1Q14671 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.216e-10■■■■■ 40.4
PUM1Q14671 RUFY1-212ENST00000508797 1074 ntTSL 313.44□□□□□ -0.266e-10■■■■■ 40.4
PUM1Q14671 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.376e-10■■■■■ 40.4
PUM1Q14671 FADS3-210ENST00000531956 841 ntTSL 515.07■□□□□ 02e-7■■■■■ 40
PUM1Q14671 FADS3-206ENST00000527379 768 ntTSL 314.83□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 40
PUM1Q14671 FADS3-208ENST00000529404 2379 ntTSL 214.42□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 40
PUM1Q14671 FADS3-211ENST00000533676 5314 ntTSL 214.24□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 40
PUM1Q14671 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.683e-10■■■■■ 39.2
PUM1Q14671 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.453e-10■■■■■ 39.2
PUM1Q14671 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.863e-10■■■■■ 39.2
PUM1Q14671 MORC3-202ENST00000484028 688 ntTSL 35.77□□□□□ -1.492e-9■■■■■ 38.9
PUM1Q14671 EEF1D-229ENST00000530109 533 ntTSL 215.83■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 38.8
PUM1Q14671 EEF1D-219ENST00000527741 3718 ntTSL 210.61□□□□□ -0.712e-9■■■■■ 38.8
PUM1Q14671 ANP32E-206ENST00000534220 512 ntTSL 57.73□□□□□ -1.179e-23■■■■■ 38
PUM1Q14671 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.431e-17■■■■■ 38
PUM1Q14671 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.382e-8■■■■■ 37.9
PUM1Q14671 ICE1-203ENST00000512608 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 46.8□□□□□ -1.322e-8■■■■■ 37.9
PUM1Q14671 ARID1A-208ENST00000532781 2583 ntTSL 1 (best)13.23□□□□□ -0.295e-9■■■■■ 37.2
PUM1Q14671 ARID1A-206ENST00000466382 2699 ntTSL 211.69□□□□□ -0.545e-9■■■■■ 37.2
PUM1Q14671 AL513165.2-202ENST00000541804 1514 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.65e-9■■■■■ 37.2
PUM1Q14671 AL513165.2-201ENST00000544475 2999 ntTSL 1 (best)10.81□□□□□ -0.685e-9■■■■■ 37.2
PUM1Q14671 ARID1A-217ENST00000637788 3046 nt9.78□□□□□ -0.845e-9■■■■■ 37.2
PUM1Q14671 ARID1A-202ENST00000374152 6460 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.975e-9■■■■■ 37.2
PUM1Q14671 HGS-203ENST00000570652 523 ntTSL 519.48■□□□□ 0.714e-9■■■■■ 37.1
PUM1Q14671 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.194e-9■■■■■ 37.1
PUM1Q14671 HGS-210ENST00000573320 547 ntTSL 315.54■□□□□ 0.084e-9■■■■■ 37.1
PUM1Q14671 HGS-211ENST00000573949 461 ntTSL 513.27□□□□□ -0.294e-9■■■■■ 37.1
PUM1Q14671 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.01■□□□□ 0.473e-10■■■■■ 36
PUM1Q14671 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.151e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.611e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.611e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.531e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 NME1-206ENST00000475573 781 ntTSL 317.37■□□□□ 0.371e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.261e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 NME1-201ENST00000013034 796 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.411e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 ATP6V1B2-204ENST00000521442 738 ntTSL 38.51□□□□□ -1.051e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 ATP6V1B2-206ENST00000523482 6907 ntTSL 25.88□□□□□ -1.471e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 34.9
PUM1Q14671 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 34.9
PUM1Q14671 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 34.9
PUM1Q14671 NDUFC2-KCTD14-201ENST00000528251 566 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 34.9
PUM1Q14671 NDUFC2-KCTD14-204ENST00000614236 386 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 34.9
PUM1Q14671 NDUFC2-205ENST00000534029 422 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 34.9
PUM1Q14671 NDUFC2-202ENST00000525085 495 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 34.9
PUM1Q14671 NDUFC2-KCTD14-203ENST00000612612 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 34.9
PUM1Q14671 NDUFC2-203ENST00000527806 1888 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 34.9
PUM1Q14671 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 34.5
PUM1Q14671 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 34.5
PUM1Q14671 PTPN11-206ENST00000635652 588 ntTSL 313.53□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 34.5
PUM1Q14671 PTPN11-205ENST00000635625 1794 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 34.5
PUM1Q14671 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.665e-7■■■■■ 34.5
PUM1Q14671 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 34.5
PUM1Q14671 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 34.5
PUM1Q14671 PFKP-207ENST00000421751 658 ntTSL 416.19■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 33.9
PUM1Q14671 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 33.9
PUM1Q14671 DNM1-222ENST00000636280 2462 ntTSL 514.94□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 33.9
PUM1Q14671 PFKP-204ENST00000407806 705 ntTSL 514.73□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 33.9
PUM1Q14671 PKN1-211ENST00000588200 548 ntTSL 314.36□□□□□ -0.112e-8■■■■■ 33.9
PUM1Q14671 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 33.9
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