Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 OGT-204ENST00000455587 632 ntTSL 310.11□□□□□ -0.795e-33■■■■■ 191.6
PUM1Q14671 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.265e-33■■■■■ 191.6
PUM1Q14671 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.415e-33■■■■■ 191.6
PUM1Q14671 OGT-210ENST00000488174 7243 ntTSL 55.92□□□□□ -1.465e-33■■■■■ 191.6
PUM1Q14671 PTDSS2-213ENST00000532614 437 ntTSL 313.63□□□□□ -0.235e-8■■■■■ 57
PUM1Q14671 EEF1B2-207ENST00000445505 515 ntTSL 517.2■□□□□ 0.345e-13■■■■■ 56.6
PUM1Q14671 FTSJ3-201ENST00000427159 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.956e-14■■■■■ 56.5
PUM1Q14671 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.796e-8■■■■■ 56
PUM1Q14671 PTDSS2-212ENST00000531520 890 ntTSL 319.44■□□□□ 0.76e-8■■■■■ 56
PUM1Q14671 PTDSS2-205ENST00000526878 3134 ntTSL 211.15□□□□□ -0.636e-8■■■■■ 56
PUM1Q14671 FADS3-212ENST00000534223 800 ntTSL 514.86□□□□□ -0.033e-9■■■■■ 55.7
PUM1Q14671 EEF1B2-204ENST00000415904 649 ntTSL 312.93□□□□□ -0.341e-12■■■■■ 52.4
PUM1Q14671 EEF1B2-206ENST00000435123 389 ntTSL 58.49□□□□□ -1.051e-12■■■■■ 52.4
PUM1Q14671 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.539e-13■■■■■ 51.7
PUM1Q14671 SAP30-202ENST00000504618 410 ntTSL 316.82■□□□□ 0.286e-12■■■■■ 48.5
PUM1Q14671 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.381e-17■■■■■ 48.1
PUM1Q14671 FAM193B-219ENST00000524677 1916 ntTSL 216.81■□□□□ 0.282e-11■■■■■ 47.3
PUM1Q14671 FAM193B-204ENST00000505569 1870 ntTSL 1 (best)16.64■□□□□ 0.252e-11■■■■■ 47.3
PUM1Q14671 FAM193B-212ENST00000510163 2237 ntTSL 1 (best)14.72□□□□□ -0.052e-11■■■■■ 47.3
PUM1Q14671 FAM193B-214ENST00000510479 2800 ntTSL 211.28□□□□□ -0.62e-11■■■■■ 47.3
PUM1Q14671 CPNE7-203ENST00000525982 576 ntTSL 522.73■■□□□ 1.234e-11■■■■■ 45.2
PUM1Q14671 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.824e-11■■■■■ 45.2
PUM1Q14671 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.281e-10■■■■■ 44
PUM1Q14671 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.561e-10■■■■■ 44
PUM1Q14671 AC136632.1-201ENST00000477964 591 ntBASIC11.64□□□□□ -0.551e-10■■■■■ 43.8
PUM1Q14671 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.116e-12■■■■■ 42.9
PUM1Q14671 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.243e-10■■■■■ 42.3
PUM1Q14671 YEATS4-201ENST00000247843 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.673e-10■■■■■ 42.3
PUM1Q14671 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC7.29□□□□□ -1.241e-9■■■■■ 41.3
PUM1Q14671 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.813e-7■■■■■ 40.6
PUM1Q14671 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.27e-10■■■■■ 40.5
PUM1Q14671 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.027e-10■■■■■ 40.5
PUM1Q14671 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.067e-10■■■■■ 40.5
PUM1Q14671 EEF1B2-205ENST00000429769 912 ntTSL 513.44□□□□□ -0.267e-10■■■■■ 40.5
PUM1Q14671 EEF1B2-208ENST00000455150 670 ntTSL 57.24□□□□□ -1.257e-10■■■■■ 40.5
PUM1Q14671 TBX1-205ENST00000484336 529 ntTSL 328.04■■■□□ 2.086e-10■■■■■ 40.4
PUM1Q14671 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.526e-10■■■■■ 40.4
PUM1Q14671 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.796e-10■■■■■ 40.4
PUM1Q14671 RUFY1-209ENST00000503583 854 ntTSL 214.76□□□□□ -0.056e-10■■■■■ 40.4
PUM1Q14671 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.196e-10■■■■■ 40.4
PUM1Q14671 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.216e-10■■■■■ 40.4
PUM1Q14671 RUFY1-212ENST00000508797 1074 ntTSL 313.44□□□□□ -0.266e-10■■■■■ 40.4
PUM1Q14671 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.376e-10■■■■■ 40.4
PUM1Q14671 FADS3-210ENST00000531956 841 ntTSL 515.07■□□□□ 02e-7■■■■■ 40
PUM1Q14671 FADS3-206ENST00000527379 768 ntTSL 314.83□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 40
PUM1Q14671 FADS3-208ENST00000529404 2379 ntTSL 214.42□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 40
PUM1Q14671 FADS3-211ENST00000533676 5314 ntTSL 214.24□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 40
PUM1Q14671 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.683e-10■■■■■ 39.2
PUM1Q14671 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.453e-10■■■■■ 39.2
PUM1Q14671 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.863e-10■■■■■ 39.2
PUM1Q14671 MORC3-202ENST00000484028 688 ntTSL 35.77□□□□□ -1.492e-9■■■■■ 38.9
PUM1Q14671 EEF1D-229ENST00000530109 533 ntTSL 215.83■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 38.8
PUM1Q14671 EEF1D-219ENST00000527741 3718 ntTSL 210.61□□□□□ -0.712e-9■■■■■ 38.8
PUM1Q14671 ANP32E-206ENST00000534220 512 ntTSL 57.73□□□□□ -1.179e-23■■■■■ 38
PUM1Q14671 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.431e-17■■■■■ 38
PUM1Q14671 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.382e-8■■■■■ 37.9
PUM1Q14671 ICE1-203ENST00000512608 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 46.8□□□□□ -1.322e-8■■■■■ 37.9
PUM1Q14671 ARID1A-208ENST00000532781 2583 ntTSL 1 (best)13.23□□□□□ -0.295e-9■■■■■ 37.2
PUM1Q14671 ARID1A-206ENST00000466382 2699 ntTSL 211.69□□□□□ -0.545e-9■■■■■ 37.2
PUM1Q14671 AL513165.2-202ENST00000541804 1514 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.65e-9■■■■■ 37.2
PUM1Q14671 AL513165.2-201ENST00000544475 2999 ntTSL 1 (best)10.81□□□□□ -0.685e-9■■■■■ 37.2
PUM1Q14671 ARID1A-217ENST00000637788 3046 nt9.78□□□□□ -0.845e-9■■■■■ 37.2
PUM1Q14671 ARID1A-202ENST00000374152 6460 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.975e-9■■■■■ 37.2
PUM1Q14671 HGS-203ENST00000570652 523 ntTSL 519.48■□□□□ 0.714e-9■■■■■ 37.1
PUM1Q14671 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.194e-9■■■■■ 37.1
PUM1Q14671 HGS-210ENST00000573320 547 ntTSL 315.54■□□□□ 0.084e-9■■■■■ 37.1
PUM1Q14671 HGS-211ENST00000573949 461 ntTSL 513.27□□□□□ -0.294e-9■■■■■ 37.1
PUM1Q14671 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.01■□□□□ 0.473e-10■■■■■ 36
PUM1Q14671 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.151e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.611e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.611e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.531e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 NME1-206ENST00000475573 781 ntTSL 317.37■□□□□ 0.371e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.261e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 NME1-201ENST00000013034 796 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.411e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 ATP6V1B2-204ENST00000521442 738 ntTSL 38.51□□□□□ -1.051e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 ATP6V1B2-206ENST00000523482 6907 ntTSL 25.88□□□□□ -1.471e-8■■■■■ 35.5
PUM1Q14671 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 34.9
PUM1Q14671 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 34.9
PUM1Q14671 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 34.9
PUM1Q14671 NDUFC2-KCTD14-201ENST00000528251 566 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 34.9
PUM1Q14671 NDUFC2-KCTD14-204ENST00000614236 386 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 34.9
PUM1Q14671 NDUFC2-205ENST00000534029 422 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 34.9
PUM1Q14671 NDUFC2-202ENST00000525085 495 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 34.9
PUM1Q14671 NDUFC2-KCTD14-203ENST00000612612 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 34.9
PUM1Q14671 NDUFC2-203ENST00000527806 1888 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 34.9
PUM1Q14671 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 34.5
PUM1Q14671 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 34.5
PUM1Q14671 PTPN11-206ENST00000635652 588 ntTSL 313.53□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 34.5
PUM1Q14671 PTPN11-205ENST00000635625 1794 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 34.5
PUM1Q14671 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.665e-7■■■■■ 34.5
PUM1Q14671 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 34.5
PUM1Q14671 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 34.5
PUM1Q14671 PFKP-207ENST00000421751 658 ntTSL 416.19■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 33.9
PUM1Q14671 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 33.9
PUM1Q14671 DNM1-222ENST00000636280 2462 ntTSL 514.94□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 33.9
PUM1Q14671 PFKP-204ENST00000407806 705 ntTSL 514.73□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 33.9
PUM1Q14671 PKN1-211ENST00000588200 548 ntTSL 314.36□□□□□ -0.112e-8■■■■■ 33.9
PUM1Q14671 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 33.9
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