RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576502.5

NDE1-211, Transcript of nudE neurodevelopment protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene NDE1, Length 1,131 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1-211ENST00000576502 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.78■■■■□ 3
NDE1-211ENST00000576502 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.2■■■□□ 2.43
NDE1-211ENST00000576502 ABCC9O60706 1549 aa29.66■■■□□ 2.34
NDE1-211ENST00000576502 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.53■■■□□ 2.16
NDE1-211ENST00000576502 NACADO15069 1562 aa28.44■■■□□ 2.14
NDE1-211ENST00000576502 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.33■■■□□ 2.13
NDE1-211ENST00000576502 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.2■■■□□ 2.1
NDE1-211ENST00000576502 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
NDE1-211ENST00000576502 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.98■■■□□ 2.07
NDE1-211ENST00000576502 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.79■■■□□ 2.04
NDE1-211ENST00000576502 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.02
NDE1-211ENST00000576502 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.54■■■□□ 2
NDE1-211ENST00000576502 SCRIBQ14160 1630 aa27.46■■□□□ 1.99
NDE1-211ENST00000576502 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.41■■□□□ 1.98
NDE1-211ENST00000576502 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.29■■□□□ 1.96
NDE1-211ENST00000576502 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
NDE1-211ENST00000576502 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.84■■□□□ 1.89
NDE1-211ENST00000576502 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.71■■□□□ 1.87
NDE1-211ENST00000576502 SMARCA4P51532 1647 aa26.27■■□□□ 1.8
NDE1-211ENST00000576502 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
NDE1-211ENST00000576502 SMARCA2P51531 1590 aa26.2■■□□□ 1.79
NDE1-211ENST00000576502 NCAPD3P42695 1498 aa26.19■■□□□ 1.78
NDE1-211ENST00000576502 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.16■■□□□ 1.78
NDE1-211ENST00000576502 HMGXB3Q12766 1538 aa26.09■■□□□ 1.77
NDE1-211ENST00000576502 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.02■■□□□ 1.76
NDE1-211ENST00000576502 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
NDE1-211ENST00000576502 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.97■■□□□ 1.75
NDE1-211ENST00000576502 WIZO95785 1651 aa25.7■■□□□ 1.7
NDE1-211ENST00000576502 ERCC6Q03468 1493 aa25.67■■□□□ 1.7
NDE1-211ENST00000576502 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
NDE1-211ENST00000576502 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.58■■□□□ 1.69
NDE1-211ENST00000576502 NESP48681 1621 aa25.55■■□□□ 1.68
NDE1-211ENST00000576502 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
NDE1-211ENST00000576502 CUX2O14529 1486 aa25.47■■□□□ 1.67
NDE1-211ENST00000576502 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.45■■□□□ 1.66
NDE1-211ENST00000576502 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.43■■□□□ 1.66
NDE1-211ENST00000576502 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.31■■□□□ 1.64
NDE1-211ENST00000576502 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
NDE1-211ENST00000576502 CFTRP13569 1480 aa25.22■■□□□ 1.63
NDE1-211ENST00000576502 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.16■■□□□ 1.62
NDE1-211ENST00000576502 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.15■■□□□ 1.62
NDE1-211ENST00000576502 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.14■■□□□ 1.61
NDE1-211ENST00000576502 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.13■■□□□ 1.61
NDE1-211ENST00000576502 PRDM2Q13029 1718 aa25.09■■□□□ 1.61
NDE1-211ENST00000576502 WDR62O43379 1518 aa25.07■■□□□ 1.6
NDE1-211ENST00000576502 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.87■■□□□ 1.57
NDE1-211ENST00000576502 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
NDE1-211ENST00000576502 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
NDE1-211ENST00000576502 ABCC8Q09428 1581 aa24.79■■□□□ 1.56
NDE1-211ENST00000576502 TOPBP1Q92547 1522 aa24.7■■□□□ 1.54
NDE1-211ENST00000576502 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.69■■□□□ 1.54
NDE1-211ENST00000576502 IFT140Q96RY7 1462 aa24.64■■□□□ 1.54
NDE1-211ENST00000576502 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
NDE1-211ENST00000576502 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
NDE1-211ENST00000576502 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
NDE1-211ENST00000576502 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
NDE1-211ENST00000576502 CUX1P39880 1505 aa24.4■■□□□ 1.5
NDE1-211ENST00000576502 SOGA1O94964 1423 aa24.39■■□□□ 1.5
NDE1-211ENST00000576502 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.38■■□□□ 1.49
NDE1-211ENST00000576502 OSCARQ8IYS5 282 aa24.37■■□□□ 1.49
NDE1-211ENST00000576502 WDR97A6NE52 1622 aa24.35■■□□□ 1.49
NDE1-211ENST00000576502 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.32■■□□□ 1.48
NDE1-211ENST00000576502 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.484e-7■□□□□ 10.5
NDE1-211ENST00000576502 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
NDE1-211ENST00000576502 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
NDE1-211ENST00000576502 TOP2BQ02880 1626 aa24.18■■□□□ 1.46
NDE1-211ENST00000576502 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.18■■□□□ 1.46
NDE1-211ENST00000576502 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.16■■□□□ 1.46
NDE1-211ENST00000576502 GRIN2BQ13224 1484 aa24.15■■□□□ 1.46
NDE1-211ENST00000576502 CHD1O14646 1710 aa24.14■■□□□ 1.45
NDE1-211ENST00000576502 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
NDE1-211ENST00000576502 FBLN2P98095 1184 aa24.12■■□□□ 1.45
NDE1-211ENST00000576502 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.12■■□□□ 1.45
NDE1-211ENST00000576502 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.11■■□□□ 1.45
NDE1-211ENST00000576502 SYNJ1O43426 1573 aa24.11■■□□□ 1.45
NDE1-211ENST00000576502 PBRM1Q86U86 1689 aa24.08■■□□□ 1.44
NDE1-211ENST00000576502 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.06■■□□□ 1.44
NDE1-211ENST00000576502 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
NDE1-211ENST00000576502 SYNJ2O15056 1496 aa24.01■■□□□ 1.43
NDE1-211ENST00000576502 TRIM41Q8WV44 630 aa23.98■■□□□ 1.43
NDE1-211ENST00000576502 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.95■■□□□ 1.42
NDE1-211ENST00000576502 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.95■■□□□ 1.42
NDE1-211ENST00000576502 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.95■■□□□ 1.42
NDE1-211ENST00000576502 ARHGEF11O15085 1522 aa23.93■■□□□ 1.42
NDE1-211ENST00000576502 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.89■■□□□ 1.42
NDE1-211ENST00000576502 ADAMTS12P58397 1594 aa23.86■■□□□ 1.41
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NDE1-211ENST00000576502 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.84■■□□□ 1.41
NDE1-211ENST00000576502 GRIN2AQ12879 1464 aa23.81■■□□□ 1.4
NDE1-211ENST00000576502 KIF27Q86VH2 1401 aa23.77■■□□□ 1.4
NDE1-211ENST00000576502 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.72■■□□□ 1.39
NDE1-211ENST00000576502 NUP160Q12769 1436 aa23.71■■□□□ 1.39
NDE1-211ENST00000576502 ARAP1Q96P48 1450 aa23.69■■□□□ 1.38
NDE1-211ENST00000576502 CUL7Q14999 1698 aa23.67■■□□□ 1.38
NDE1-211ENST00000576502 CEP170Q5SW79 1584 aa23.66■■□□□ 1.38
NDE1-211ENST00000576502 IGF1RP08069 1367 aa23.61■■□□□ 1.37
NDE1-211ENST00000576502 SHROOM2Q13796 1616 aa23.55■■□□□ 1.36
NDE1-211ENST00000576502 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.52■■□□□ 1.36
NDE1-211ENST00000576502 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.5■■□□□ 1.35
NDE1-211ENST00000576502 JPH4Q96JJ6 628 aa23.47■■□□□ 1.35
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