Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y294

ASF1A, Histone chaperone ASF1A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1AQ9Y294 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASF1AQ9Y294 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASF1AQ9Y294 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASF1AQ9Y294 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASF1AQ9Y294 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms